Description du sujet de thèse

Les structures secondaires de l’ADN, alternative à la structure en double hélice, n’interviennent pas seulement dans la topologie de l’ADN mais jouent aussi vraisemblablement un rôle régulateur et fonctionnel dans les génomes mammifères. C’est en particulier le cas pour les structures de type G-quadruplex qui forment des ADN simple brins stable in vitro. Notre laboratoire a récemment montré que ces structures sont importantes pour l’expression des gènes au niveau des promoteurs en promouvant l’ouverture de la chromatine, notamment grâce à l’utilisation d’une nouvelle technique permettant leur cartographie dans un contexte cellulaire. Ce sujet de thèse a pour but de mettre en évidence le rôle des G4s dans un l’insulation des domaines de chromatine. Il permettra de tester l’hypothèse que les G4s peuvent contribuer à séparer des domaines topologiques ou des domaines actifs et inactifs de la chromatine. Pour ce faire, divers outils de génomique fonctionnelle seront utilisés ainsi que des techniques de modification du génome. Ce travail sera mené dans un cadre collaboratif avec une équipe de Gif-sur-Yvette spécialisée dans l’étude de l’insulation.

Contexte de travail

L’étudiante ou l’étudiant sera encadré par Jean-Christophe Andrau à l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), et aura accès à de nombreuses plateformes technologiques. Il/elle aura également l’opportunité de se former en bioinformatique dans le laboratoire et dans le cadre d’un atelier organisé par le laboratoire. Nous recherchons une candidate ou un candidat motivé et enthousiaste avec une solide expérience dans au moins un des domaines suivants : biologie moléculaire, génomique fonctionnelle, bioinformatique ainsi que de bonnes connaissances dans le domaine de la chromatine et la transcription eucaryote.

Contraintes et risques

- Variabilité possible des horaires de travail (soir et/ou week-end)