Doctorat (H/F) - Reconnaissance et auto-organisation du glycocalyx : rôle de l’organisation des ligands

Description du Poste

Sujet De Thèse

Les candidatures sont ouvertes pour un poste de doctorant(e) MSCA d’une durée de 36 mois au CNRS / Université Grenoble Alpes (UGA) (laboratoire DCM) dans le cadre du réseau doctoral Marie Skłodowska-Curie GLYCOCALYX.

GLYCOCALYX réunit 15 partenaires européens de premier plan au sein d’un réseau transnational mettant en œuvre un programme de recherche et de formation multidisciplinaire et intersectoriel entre partenaires académiques et industriels, consacré à l’étude de l’auto-organisation et des fonctions de barrière du glycocalyx des mammifères.
Pratiquement toutes les cellules de mammifères sont recouvertes d’une couche dense et complexe de chaînes sucrées (glycanes) appelée glycocalyx, essentielle à la vie multicellulaire. Les glycocalyces remplissent des fonctions cruciales dans la communication intercellulaire, en contrôlant le développement des tissus, l’homéostasie et la réparation, les réponses inflammatoires et immunitaires, la connectivité neuronale et la symbiose avec les bactéries. Cependant, lorsqu’ils sont dérégulés, ils peuvent favoriser les maladies immunitaires, la neurodégénérescence et le cancer. Les glycocalyces constituent également une première ligne de défense contre les agents pathogènes, même si certains pathogènes ont évolué pour détourner le glycocalyx afin de favoriser l’infection.
Malgré leur importance, les glycocalyces des mammifères demeurent une sorte de « matière noire » de la biologie, encore peu étudiée en raison du manque historique d’outils préparatifs et analytiques permettant de sonder la composition moléculaire locale et les interactions transitoires au sein des glycocalyces, ainsi que de l’absence de règles physiques permettant d’interpréter les observations expérimentales.
Le réseau GLYCOCALYX formera 15 doctorant(e)s aux méthodes et concepts de la chimie, de la physique et de la biologie nécessaires pour décrypter l’organisation dynamique des glycocalyces. Le projet établira un nouveau niveau de compréhension de la manière dont les glycocalyces assurent leurs multiples fonctions sélectives de barrière. Les doctorant(e)s recevront une formation scientifique de pointe, complétée par des compétences transversales pertinentes pour l’industrie, afin de les préparer à des carrières dans le secteur des technologies médicales ainsi que dans la recherche et l’innovation qui le sous-tendent.

À propos du projet de doctorat « Reconnaissance et auto-organisation du glycocalyx : rôle de l’organisation des ligands »
En tant que doctorant(e) MSCA au Département de Chimie Moléculaire (CNRS-UGA, Grenoble), vous développerez des glycocalyces synthétiques présentant une affinité, une densité et une distribution des ligands modulables, et vous les utiliserez pour déterminer comment la valence des ligands et des agents de réticulation gouverne la reconnaissance multivalente supersélective ainsi que les propriétés physiques de films de type glycocalyx.
Les interactions multivalentes transitoires sont omniprésentes dans les glycocalyces. Elles contrôlent la reconnaissance entre le glycocalyx et les protéines de signalisation, les vésicules extracellulaires et les agents pathogènes (toxines, virus), et contribuent également à l’organisation supramoléculaire du glycocalyx lui-même (par exemple via la réticulation macromoléculaire). Les interactions multivalentes sont par nature sensibles à la disposition spatiale des sites de liaison, mais l’influence de la distribution des ligands sur la reconnaissance et l’auto-organisation du glycocalyx reste mal comprise. La complexité et le faible contrôle de la composition et de l’organisation des glycocalyces cellulaires rendent ces études particulièrement difficiles. L’objectif de ce projet est d’élucider comment le regroupement des ligands, par opposition à une distribution homogène, influence la reconnaissance du glycocalyx et ses propriétés physiques.
Ce projet combinera des expertises en synthèse bioorganique, en conception de surfaces biomimétiques et en caractérisation physico-chimique avancée afin de développer de nouveaux outils chimiques pour fabriquer des glycocalyces « sur mesure ». En confrontant les données expérimentales à la théorie et aux simulations numériques (en collaboration avec les partenaires du réseau), il visera à définir des règles physiques fondamentales permettant de prédire comment le regroupement des ligands affecte la reconnaissance et l’auto-organisation du glycocalyx. Les résultats apporteront une compréhension plus approfondie des interactions multivalentes et pourraient ouvrir de nouvelles voies pour contrôler les interactions du glycocalyx dans des applications biomédicales.
Vous interagirez et développerez des collaborations de recherche avec nos partenaires académiques et industriels du réseau GLYCOCALYX. En outre, vous participerez aux activités du réseau doctoral, notamment à des formations et à des séjours de recherche sur d’autres sites.

Compétences attendues :
Nous recherchons un(e) physico-chimiste expérimental(e), biophysicien(ne) ou physicien(ne) de la matière molle enthousiaste et rigoureux(se), disposant de solides compétences expérimentales et d’un fort intérêt pour le travail multidisciplinaire. Une expérience préalable en techniques de caractérisation de surface, en analyse d’interactions biomoléculaires, en fonctionnalisation de surfaces et/ou en synthèse bioorganique est indispensable. Les candidats devront également manifester un fort intérêt pour la recherche interdisciplinaire à l’interface entre chimie, physique et biologie. Le poste requiert d’excellentes capacités de communication, à l’écrit comme à l’oral, ainsi que de solides compétences organisationnelles. Les candidats devront être capables de gérer efficacement leur temps, de respecter les échéances et de faire face à des demandes concurrentes de manière autonome et responsable. Une aptitude avérée à travailler à la fois de manière indépendante et au sein d’une équipe est également attendue.

Une formation aux techniques expérimentales requises sera assurée au sein du laboratoire d’accueil ainsi que par le réseau GLYCOCALYX. Néanmoins, une expérience préalable dans le domaine des biointerfaces, ainsi que des compétences en programmation et/ou en simulation, constitueront un atout. De même, une expérience de contribution à des publications dans des revues internationales à comité de lecture, ou des résultats de recherche en cours présentant un potentiel de publication, sera appréciée.

Pour déposer votre candidature, merci de respecter les conditions d'éligibilité des réseaux de formation doctorale - MSCA Doctoral Networks que vous trouverez directement sur ce site https://www.horizon-europe.gouv.fr/les-reseaux-de-formation-doctorale-msca-doctoral-networks-27884

Votre Environnement de Travail

Le travail sera réalisé sous la supervision de Dr G. Dubacheva au sein de l’équipe I2BM du DCM (Département de Chimie Moléculaire, CNRS-UGA). Les recherches menées par I2BM portent sur la conception d’architectures macromoléculaires et d’interfaces fonctionnelles pour des applications en bioanalyse et en thérapeutique (https://dcm.univ-grenoble-alpes.fr/research/ingenierie-et-interactions-biomoleculaires). Le/la candidat(e) sera basé(e) à Grenoble, avec des secondments dans d’autres laboratoires du réseau. Grenoble est la plus grande ville des Alpes françaises. C’est l’un des principaux pôles scientifiques en France, offrant un environnement scientifique dynamique et collaboratif.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Rémunération et avantages

Rémunération

La rémunération brute est d'environ 3400,00 € brut mensuel à laquelle s'ajoute une indemnité de mobilité de 710€/mois et, si applicable, un supplément familial

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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