PhD position: Structural characterization of lipid-associated IAPP and Aβ Fibrils in Type 2 Diabetes and Alzheimer's Disease (M/F)

Job Description

Thesis Subject

Projet du réseau doctoral LipAgg Le projet LipAgg (https://lipagg.eu/) vise à élucider les complexités structurelles des agrégats protéino-lipidiques amyloïdes et à étudier leur rôle dans l'agrégation pathologique, la toxicité cellulaire et la propagation intercellulaire. En se concentrant sur les principales protéines amyloïdes humaines — l'amyline (IAPP), la bêta-amyloïde (Aβ) et l'α-synucléine (αS) — associées respectivement au diabète de type 2 (DT2), à la maladie d'Alzheimer (MA) et à la maladie de Parkinson (MP), le projet s'appuie sur les récentes découvertes du consortium. Ces résultats mettent en évidence le rôle crucial des lipides libres dans la détérioration membranaire par la formation de complexes lipides-protéines amyloïdogènes stables, conduisant à l'hypothèse « lipide-chaperon ». Programme du réseau doctoral LipAgg Le doctorant sélectionné participera au projet LipAgg, financé par l'UE (HORIZON-MSCA-DN-2024-01). Le réseau LipAgg rassemble des partenaires de 6 pays européens et comprend 11 institutions universitaires ou de recherche et 12 partenaires industriels. Le consortium s'engage à offrir un programme de formation d'excellence à 15 doctorants (DC) visant à élucider le rôle des lipides dans la toxicité et la propagation de l'agrégation protéique. Titre : Caractérisation structurale des fibrilles IAPP et Aβ associées aux lipides dans le diabète de type 2 et la maladie d'Alzheimer.
Objectifs : Ce projet a pour but de déterminer les structures du polypeptide amyloïde des îlots pancréatiques (IAPP) et de l'amyloïde-β (Aβ) à l'aide de la cryomicroscopie électronique (cryo-ME). Les fibrilles amyloïdes seront d'abord caractérisées seules, puis en présence de lipides libres spécifiques et de membranes modèles. Des lipides conventionnels (tels que la phosphatidylcholine et la phosphatidylsérine) et des lipides moins conventionnels seront sélectionnés en collaboration avec deux autres doctorants du consortium (DC1 et DC3). Des agrégats de plus petite taille seront également étudiés par microscopie électronique, bien qu'à une résolution inférieure en raison de leur taille et de leur hétérogénéité structurelle. Toutes les données structurales obtenues par cryo-EM seront corrélées avec des tests de toxicité réalisés par le doctorant DC7.

Mots-clés : protéines amyloïdes, interactions lipides/protéines, cryo-microscopie électronique, fluorescence

Le poste
Les principales missions du doctorant consisteront à gérer et à mener à bien le projet de recherche qui lui sera confié, à participer aux activités de formation et de mise en réseau du réseau LipAgg, à suivre des cours de doctorat, à rédiger des articles scientifiques et sa thèse de doctorat, à participer à des congrès et réunions scientifiques nationaux et internationaux, à effectuer un séjour de recherche dans un laboratoire externe au sein du réseau LipAgg, et à diffuser les résultats scientifiques obtenus.

La date de prise de fonction prévue est le 1er septembre 2026.

Documents requis
CV - incluant les compétences méthodologiques
Lettre de motivation
Copie du diplôme de master (ou preuve de l'obtention prévue)
Mémoire de master (si disponible)
Tous les relevés de notes
Coordonnées d'au moins deux références

Your Work Environment

Le candidat idéal pour ce poste est un chercheur hautement motivé et talentueux, titulaire d'un master (MSc ou équivalent) en biophysique, physique chimique, biochimie ou biologie structurale. Il doit apprécier le défi que représentent les concepts scientifiques novateurs et faire preuve d'une grande motivation, de persévérance et d'une attitude axée sur les résultats. Il doit être capable de travailler aussi bien de manière autonome qu'au sein d'une équipe interdisciplinaire. D'excellentes compétences en communication orale et écrite en anglais sont requises. De solides compétences en matière d'organisation et de planification sont également nécessaires. Ce poste est soumis aux règles de mobilité et d'éligibilité des actions Marie Sklodowska-Curie. En particulier, le candidat ne doit pas avoir résidé ou exercé son activité principale (travail, études, etc.) en France pendant plus de douze mois au cours des trois années précédant immédiatement la date de recrutement, sauf dans le cadre d'une procédure d'obtention du statut de réfugié au titre de la Convention de Genève. À la date de recrutement, le candidat doit être doctorant, c'est-à-dire en être à ses cinq premières années (expérience de recherche équivalente à temps plein) de carrière de chercheur et ne pas avoir obtenu de doctorat.

Compensation and benefits

Compensation

un salaire brut de 3 298 euros par mois au titre de l'indemnité de subsistance et de 710 euros par mois au titre de l'indemnité de mobilité

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

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