Thèse en bioinformatique/modélisation structurale (H/F)
Nouveau
- CDD Doctorant
- 36 mois
- Doctorat
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule
Type de Contrat
CDD Doctorant
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
69364 LYON 07
Durée du contrat
36 mois
Date d'Embauche
01/01/2027
Rémuneration
La rémunération est de 2 300€ brut mensuel
Postuler Date limite de candidature : dimanche 22 novembre 2026 23:59
Description du Poste
Sujet De Thèse
Le/la doctorant(e) recruté(e) contribuera au projet PREBACTOR (ANR 2026), qui vise à élucider les mécanismes moléculaires de la prédation bactérienne chez Myxococcus xanthus, une bactérie prédateur clé des écosystèmes telluriques. Plus précisément, il/elle se concentrera sur la génération d’un réseau d’interactions protéine-protéine (PPI) entre les appareils Kil et T3SS* à l’aide de modèles de prédiction structurale basés sur des réseaux de neurones profonds (AlphaFold2/3, Boltz-2, RosettaFold3, etc.).
L’objectif est de cartographier les interactions intra- et inter-complexes entre les protéines de ces deux systèmes, essentiels pour la prédation par contact.
Votre Environnement de Travail
Le/la doctorant(e) sera accueilli(e) au Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule (LBMC, UMR5239), à l’École Normale Supérieure de Lyon, au sein de l’équipe DAMM (Riccardo Pellarin et Juliette Martin). L’équipe est spécialisée dans la modélisation des assemblages macromoléculaires et l’utilisation de méthodes computationnelles pour étudier les interactions protéiques à grande échelle. Le LBMC dispose d’un accès privilégié aux ressources du Centre Blaise Pascal (CBP) et du Pôle Scientifique de Modélisation Numérique (PSMN), incluant des clusters de calcul équipés de GPU haut de gamme (H200, GH200, A6000, etc.)
Contraintes et risques
pas de risque identifié
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est de 2 300€ brut mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR5239-JULMAR-002 |
|---|---|
| Section(s) CN / Domaine de recherche | Mathématiques et interactions des mathématiques |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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