Description du sujet de thèse

Chez les bactéries, la ségrégation de l'ADN repose principalement sur le système ParABS qui sépare les molécules d'ADN lors de la division cellulaire. L'objective de cette thèse est de réaliser la modélisation biophysique de ce processus avec les outils de la physique théorique afin d'obtenir une compréhension holistique, quantitative et moléculaire du mécanisme principal gouvernant la ségrégation du génome bactérien. Nous utiliserons des approches intégratives et multidisciplinaires. Nos collaborateurs microbiologistes de l'équipe de Jean-Yves BOUET (CBI, Toulouse) réaliseront les expériences en génétique et génomique, en biologie cellulaire et en biochimie pour tester nos prédictions. Ce projet est basé sur une collaboration établie, notre but est de déchiffrer les mécanismes qui (i) dirige l'auto-assemblée du complexe de nucléoprotéines (protéines ParB) impliqué dans la partition du système de partition archétypique ParABS du plasmide F chez E. coli. Cette partie implique une séparation de phase liquide-liquide de protéines en interaction avec un polymère et (ii) la séparation et le positionnement des complexes de chaque côté du plan de division (grâce à l'action des protéines ParA). Cette partie implique la dynamique couplée de différentes espèces de protéines. Nous investiguerons à la fois l'interaction entre deux auto-assemblée dynamiques de protéines ParA et ParB, ainsi que la formation et la transmission d'organelles sans membranes.

Contexte de travail

Le doctorant ou la doctorante travaillera au Laboratoire Charles Coulomb sous la supervision de Jean-Charles Walter, membre de l'équipe Systèmes Complexes et Physique Non-linéaire

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Le ou la candidate devra avoir une formation en physique théorique. Il/elle aura des compétences en simulations numériques (par exemple, méthodes Monte Carlo, dynamique de Langevin ou dynamique moléculaire) et en calculs analytiques. Il est recommandé d'avoir un fort intérêt pour la modélisation de processus biologiques et pour la biologie en général.