Informations générales
Intitulé de l'offre : Formalisation des processus écologiques et évolutifs par des approches bio-mathématiques, bio-statistiques et bio-informatiques H/F
Acronyme : PROBIE
Référence : CPJ-2025-027
Établissement porteur : Centre national de la recherche scientifique
Nom du chef d’établissement : Antoine PETIT
Site(s) concerné(s) : Grenoble Alpes
Région(s) académique(s) : Genoble
Etablissement(s) partenaire(s) envisagé(s) : Université Grenoble Alpes (UGA)
Code(s) établissement(s) :
Date de publication :
mardi 20 mai 2025
Type de contrat :
Chaire de professeur Junior
Durée du contrat : entre 3 et 6 ans en fonction du projet de recherche et du profil du lauréat
Quotité de travail :
Complet
Rémunération :
Rémunération brute annuelle de 54600 Euros à 57800 Euros selon l’expérience professionnelle
Thématique scientifique : Mathématiques & Environnement, agronomie, écologie
Section(s) CN :
29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés
41 - Mathématiques et interactions des mathématiques
Profil Recherché
Titulaire d’un doctorat ou diplôme équivalent ou justifiant de titres et travaux scientifiques jugés équivalents par l’instance compétente de l’établissement. Il n’y a aucune condition d’âge ou de nationalité pour candidater. Tous les emplois CNRS sont accessibles aux personnes en situation de handicap en bénéficiant d’aménagement d’épreuves rendus nécessaires par la nature du handicap
Stratégie d'établissement
La formalisation des processus écologiques et évolutifs par des approches bio-mathématiques, bio-statistiques et bio-informatiques constitue une composante historique et fondamentale du domaine, essentielle pour appréhender la complexité des systèmes vivants à des échelles de temps et d’espaces difficilement observables. Modélisation, scénarisation et prédiction sont aujourd’hui au centre de nombreux enjeux scientifiques et sociétaux, et s’appuient sur la disponibilité de données inédites (de plus en plus massives, hétérogènes et donc complexes à analyser et synthétiser) et de nouvelles opportunités méthodologiques (e.g. apprentissage profond). Afin de pleinement tirer profit de ces possibilités, il est primordial de maintenir et même renforcer le potentiel de recherche du CNRS à l’interface entre modélisation (au sens large), écologie et évolution.
Stratégie du laboratoire d'accueil
Le Laboratoire d’Écologie Alpine (LECA, UMR5553) vise à comprendre la dynamique de la biodiversité face aux changements environnementaux au travers des échelles spatiales et temporelles. Le LECA exploite des mégadonnées caractérisant les écosystèmes en intégrant la télédétection, les nouvelles méthodes d’observation (ADNe, métagénomique, acoustique, pièges-photos) et intelligence artificielle pour modéliser la biodiversité.
Le Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK, UMR5224) est une unité de recherche en mathématiques appliquées, incluant dans ses équipes de recherche plusieurs thèmes liés à l’écologie et aux sciences du vivant comme l'analyse et le traitement des données du vivant : données omiques, pharmacologie, oncologie, biologie cellulaire, sciences cognitives, psychologie, phonétique, neurosciences, environnement.
Le LJK et le LECA collaborent au sein de l’institut multidisciplinaire d’intelligence artificielle de l’UGA.
Stratégie Internationale
La lauréate ou le lauréat de la chaire devra mettre en œuvre des actions et des partenariats dans le champ thématique et s’engager notamment à déposer un projet dans le cadre des appels européens (ERC, Consortium Horizon Europe, etc.) au cours des 5 années de son contrat. Celui-ci devra s’inscrire dans la politique de site (Grenoble) ou nationale (centre AISSAI) visant à développer l’utilisation de l’IA dans le champ de la biologie de l’évolution ou de l’écologie.
L'implication de la lauréate ou du lauréat dans d’éventuelles formations internationales est attendue quand elles existent sur le sujet (par exemple, …).
Répertoire national des structures de recherche (RNSR) du laboratoire d'accueil
Laboratoire d'Écologie Alpine
Laboratoire Jean Kuntzmann
Résumé du projet scientifique
Les récentes avancées dans le domaine de la science des données, associées à la révolution des technologies numériques et satellitaires, ont amélioré le potentiel des applications de l'intelligence artificielle (IA) dans les secteurs de l’écologie et de la biologie évolutive. Cependant, l'expansion rapide des projets de développement, de l'agriculture et des zones urbaines menace la biodiversité sur le court terme. Sur des aspects plus théoriques, imaginer de nouvelles méthodes de modélisation pour mettre en lien les dernières données en génomiques, phylogénétiques, ou phénotypiques permet de franchir un cap dans notre compréhension des processus évolutifs existant à différentes échelles. C'est le cas par exemple si les tendances macro-évolutives sont régies par les principes de la micro-évolution.
Résumé du projet d'enseignement
La personne recrutée interviendra dans des enseignements de haut niveau avec une spécialisation mathématiques, préférentiellement . Elle pourra être amenée à proposer en liens avec des enseignements interdisciplinaires dans les thématiques de la chaire (interface biologie, statistiques, modélisation, traitement de données complexes, bases de données…).
Environnement Financier
- Total financé (dont package ANR) : 200 k€
- Total du projet : 0 k€
Diffusion scientifique
La diffusion des résultats passera par des avancées scientifiques de niveau mondial, qui peuvent se caractériser par des productions de tout type : publications, logiciels, brevets, livres… Par ailleurs, le projet mettra en œuvre une communication vers des cibles diverses telles que communautés scientifiques, médias, décideurs, grand public, scolaires, etc., avec un calendrier adapté. Des outils spécifiques pourront être développés comme des sites web, des newsletters ou encore des rencontres, colloques internationaux, écoles d’été et conférences.
Science ouverte
Le CNRS développe une politique forte en faveur de la science ouverte. La science ouverte consiste à rendre « accessibles autant que possible et fermés autant que nécessaire » les résultats de la recherche. À ce titre, le CNRS vise à ce que 100 % des textes des publications issues des travaux de ses unités soient rendues accessibles à tous, notamment grâce au dépôt dans HAL. Les données produites doivent aussi être rendues disponibles et réutilisables, sauf restriction particulière. Par ailleurs, les principes directeurs de l’évaluation individuelle sont revus en conformité avec la déclaration DORA, plus qualitatifs et tenant compte de toutes les facettes du métier de chercheur.
Science et société
La relation science-société est désormais reconnue comme une dimension à part entière de l'activité scientifique. Le projet développera cette dimension en synergie avec tous les partenaires. Les travaux de recherche qui en seront issus contribueront à éclairer la décision publique. Des initiatives de sciences participatives pourront être initiées avec des acteurs de l’écosystème socio-économique et culturel du projet.
Indicateurs
L’activité sera évaluée notamment sur la base de la production scientifique (publications, logiciels, brevets, livres …), sur les partenariats institutionnels et privés formalisés par des contrats, sur le rayonnement international, sur la valorisation des travaux vers des communautés scientifiques pluridisciplinaires, sur l’innovation et son transfert vers la société et sur la diffusion scientifique à destination de publics non spécialistes.
Modalités d'organisation des auditions
Seul(e)s seront convoqué(e)s aux auditions les candidat(e)s sélectionné(e)s sur dossier par la commission de sélection