Missions

La mission consiste à mener des recherches sur des bactéries probiotiques et leur impact sur le métabolisme lipidique de l'organisme entier ou au niveau du tractus digestif. Il s'agira de déterminer si un insecte, la mouche du vinaigre Drosophila melanogaster, organisme expérimental dont la biologie est particulièrement bien connue, et manipulable génétiquement, peut être utilisé pour modéliser les effets d'un cocktail probiotique sur le métabolisme lipidique révélés par une étude clinique afin de rechercher, à plus long terme, le mécanisme d'action. Un volet annexe consistera à tester la capacité de polysaccharides développés à partir de la pharmacopée chinoise à protéger la drosophile de l'ingestion de composés chimiques nocifs.

Activités

- Cultiver des lignées de drosophile (entretien ; génération de drosophiles axéniques et ré-association avec des probiotiques) et réaliser des croisements génétiques simples
- Cultiver des souches bactériennes (aérobie et anaérobie ; identification moléculaire des souches)
- Quantifier des métabolites dans des extraits, essentiellement acides gras et triglycérides, et carbohydrates (sucres)
- Analyser l'expression des gènes, des protéines (design de primers pour PCR et RTqPCR et réalisation de ces techniques)
- Concevoir et réaliser des expériences de manière autonome, analyser les résultats, rédiger et présenter oralement les résultats, aussi en anglais si nécessaire. Préparer des figures pour publication.
- Connaître et suivre l'état de l'art dans le domaine de la recherche.
- Participer aux tâches du laboratoire, par exemple, la responsabilité de l'équipement et entretien des souches de drosophile).

Compétences

- Connaissance de biologie/physiologie ou microbiologie bactérienne et du domaine général de recherche, documentée si possible par une ou plusieurs publications dans le domaine. L’expérience du modèle drosophile est un atout.
- Anglais niveau C1 en vertu du Cadre Européen Commun de Référence pour les Langues"; C1 correspondant au niveau autonome.
- Autonomie, capacité à critiquer/analyser son travail personnel et celui de ses collègues avec des propositions constructives.
- Capacité à encadrer des stagiaires et des étudiants
- Diplôme requis : Master

Contexte de travail

L'ingénieur(e) intégrera une équipe au sein de l'unité « Modèles insectes d'immunité innée » (CNRS UPR9022) animée par le Dr. Dominique Ferrandon et travaillera directement avec lui. Cette équipe a une forte expertise dans le domaine des défenses de l'hôte contre les infections et les xénobiotiques, en particulier au niveau du tractus digestif. L'Unité se situe au meilleur niveau international en ce qui concerne l'étude de l'immunité des insectes.
Le projet découle d'un contrat privé avec une firme avec laquelle notre Unité entretient des relations depuis plusieurs années.
La personne recrutée aura accès à tous les moyens de l'Unité ainsi qu'aux conditions des agents du CNRS en termes de formation, suivi de carrière, et prestations sociales diverses.

Contraintes et risques

- Contraintes habituelles liées au travail en laboratoire de biologie, suivi des expériences et entretien des lignées de drosophile et de bactéries). Intervention ponctuelle éventuellement au cours du week-end pour lancer une culture bactérienne.
38h30/semaine