Informations générales
Intitulé de l'offre : Poste d'ingénieur de recherche H/F en microbiologie et biologie moléculaire
Référence : UPR9002-STEMAR-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : lundi 27 février 2023
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 6 mois
Date d'embauche prévue : 22 mai 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2609,39 et 2796,03 euros bruts mensuels.
Niveau d'études souhaité : Bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Missions
La mission consistera en l'analyse des modifications des ARN ribosomiques de Staphylococcus aureus dans différentes conditions de stress rencontrées lors des infections. Cette cartographie sera réalisée à l'aide d'une combinaison de méthodologies innovantes, notamment la spectrométrie de masse, le séquençage haut débit, et la cryo microscopie électronique. L'impact des variations des modifications sera analysé sur la traduction au moyen d'un système de traduction in vitro. Des mutations au niveau des enzymes de modification correspondantes seront réalisées pour analyser leur fonction dans la physiologie et la pathogénicité de S. aureus.
Activités
Les activités consisteront en : (1) la purification des ARNr de S. aureus à partir de différentes cultures bactériennes soumises à divers stress et l'analyse des changements des modifications par spectrométrie de masse (UPR 9002, Strasbourg), par RNA-seq (IMoPA, Nancy) et par cryo-EM (IGBMC); (2) une analyse comparative des ribosomes (portant des variations au niveau des bases modifiées) dans un système de traduction in vitro et in vivo par des expériences de profilage des ribosomes; (3) une étude phénotypique de souches mutantes au niveau des gènes codant pour des enzymes clés de la modification des ribosomes à l'origine des variations de modifications en conditions de stress.
Compétences
• L'ingénieur-e devra posséder des connaissances générales en microbiologie moléculaire.
• L'ingénieur-e devra avoir une forte expérience dans le domaine de la biologie de l'ARN.
• L'ingénieur-e devra avoir des connaissances et compétences dans le domaine de la traduction bactérienne.
• L'ingénieur-e devra être en mesure de piloter le projet de manière autonome et devra maitriser la langue anglaise écrite et parlée (niveau B2).
Contexte de travail
L'ingénieur-e sera affecté-e à l'unité « Architecture et Réactivité de l'ARN » qui comporte 10 équipes travaillant sur divers aspects de la biologie de l'ARN en lien avec diverses pathologies infectieuses chez l'Homme. Il/elle travaillera dans l'équipe « ARNm et ARN régulateurs bactériens » reconnue pour ses travaux sur l'étude de la traduction et de son contrôle chez les bactéries, et sur le rôle des ARN dans la régulation de l'expression des gènes de Staphylococcus aureus. Il/elle travaillera sous la responsabilité d'un chercheur CNRS dans le cadre de son projet ANR dont l'objectif principal est de caractériser la fonction des modifications des ARN dans l'adaptation de S. aureus aux conditions de stress et à l'hôte. L'ingénieur-e bénéficiera d'un environnement scientifique stimulant et aura accès aux équipements et plateaux techniques de l'unité et de l'institut nécessaires au projet. L'UPR est située sur le campus universitaire de Strasbourg à l'Esplanade, un site accessible par les transports en commun et proche des restaurants subventionnés.
Contraintes et risques
La manipulation des bactéries pathogènes de classe II nécessitera de travailler dans des laboratoires LSB2 où il sera requis d'appliquer les règles d'hygiène et de sécurité.