Missions

L’ingénieur(e) (H/F) recruté(e) travaillera au sein de deux équipes de recherche de l'IBMP. A 60% de son temps, l’ingénieur(e) travaillera au sein de l'équipe "Dynamique des ARN messagers chez les plantes" sous la supervision du Dr Rémy Merret. A 40% de son temps, l’ingénieur(e) travaillera au sein de l'équipe "Métabolisme et trafic des ARN dans la cellule végétale" sous la supervision du Dr. Laurence Drouard. Il/elle participera à l'analyse de données de séquençage issues des différentes projets des deux équipes. Il/elle travaillera sur différents projets visant à comprendre l'importance de la régulation des ARN messagers et des ARN de transfert dans le développement et la réponse au stress chez les plantes. Il/elle sera amené à travailler avec des donnée issues de différentes plantes modèles.

Activités

L’ingénieur(e):
- participera à l'analyse des données issues de différents projets de séquençage
- travaillera sur des données variées issues de séquençage Illumina et Nanopore
- participera à l’analyse des résultats obtenus en interaction avec les deux responsables d'équipe
- présentera ses résultats lors de réunions d’équipe
- formera les étudiants des deux équipes aux analyses de base en bioinformatique

Compétences

Avoir des connaissances approfondies en bioinformatique et en analyses de données.
Savoir analyser des données issues de séquençage Illumina et Nanopore.
Savoir utiliser un cluster de calcul et l’utilisation de logiciels appropriés pour l’analyse de données NGS.
Savoir présenter ses résultats en réunion d'équipe en français et en anglais
Savoir réaliser des analyses statistiques appropriées.
Un niveau d'anglais B1 minimum est requis pour ce poste.

Contexte de travail

Le poste proposé est prévu pour une durée de 13 mois. L’ingénieur(e) recruté(e) travaillera à l'institut de biologie moléculaire des plantes à Strasbourg. Il/elle intégrera l'équipe « Dynamique des ARN messagers chez les plantes » dirigée par Rémy Merret et l'équipe "Métabolisme et trafic des ARN dans la cellule végétale" co-dirigée par Laurence Drouard et Anne-Marie Duchêne" et dont les objectifs principaux sont de mieux comprendre l'importance de la régulation des ARN messagers et des ARN de transfert dans le développement et la réponse au stress chez les plantes. L’ingénieur(e) pourra interagir avec les membres de la plateforme de bioinformatique de l'institut.

Une restauration universitaire est disponible sur le campus. L'institut est aussi facile d'accès via les transports en commun.

Contraintes et risques

Certains déplacements en France et en Europe peuvent être envisagées pour des collaborations.

Il n'y a pas de contraintes particulières sur ce poste.