Missions

Mission principale : Contribuer à un projet de recherche visant à caractériser les fonctions et le mécanisme d'action d'une nouvelle protéine de liaison à l'ARN double brin (ARNdb) impliquée dans la réponse antivirale des plantes, en vue d'une poursuite en thèse.

Activités

Approches génétiques et moléculaires :
• Génération et phénotypage de mutants CRISPR-Cas9 chez Arabidopsis
• Infections contrôlées avec différents virus (sauvages et mutants)
• Extraction et analyse d'ARN (qRT-PCR, préparation librairies RNA-seq)
Biochimie et biologie structurale :
• Purification de la protéine d'intérêt et tests d'activité (RNase, liaison à l'ARNdb)
• Co-immunoprécipitation et analyse de complexes protéine-ARN
• Collaboration pour études structurales (CryoEM, cristallographie)
Biologie cellulaire :
• Suivi spatio-temporel de protéines à l'aide de marqueurs fluorescents (microscopie confocale et à super-résolution)
• Études ultra-structurales par microscopie électronique à transmission
Analyse de données :
• Traitement des données (RNA-seq, microscopie etc...)
• Rédaction de protocoles et synthèse des résultats

Compétences

- Savoir-faire techniques requis :
Maîtrise des techniques de biologie moléculaire (clonage, PCR, électrophorèse)
Expérience en virologie végétale ou microbiologie (niveau L2)
Maitrise des techniques de biochimie des protéines (production, purification, analyse)
- Qualités personnelles :
Rigueur méthodologique et sens de l'organisation
Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
Autonomie dans la gestion des expérimentations
Résilience, capacité à surmonter les situations difficiles intrinsèques à la recherche scientifique
- Atouts complémentaires :
Première expérience avec la génétique des plantes
Connaissance des mécanismes de RNA silencing

Contexte de travail

Intégration dans une équipe dynamique de 7 personnes spécialisée en virologie végétale au sein de l'institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP) en lien étroit avec le laboratoire d'excellence et cluster de Recherche "NetRNA" de Strasbourg (https://labex-netrna.cnrs.fr/).
L'IBMP est une unité majeure du CNRS dédiée à la recherche dans les domaines de la biologie végétale en France et dispose d'une reconnaissance à l'international. L'IBMP est doté de plateformes techniques de pointe (séquençage, microscopie, chambres de culture pour plantes, etc...).
Le réseau NetRNA constitue un environnement stimulant favorisant la formation continue et la publication scientifique. La personne recrutée travaillera en étroite collaboration avec un chercheur contractuel de l'équipe.

Contraintes et risques

- Aspects techniques :
Manipulation d'agents biologiques de niveau 2 (virus végétaux)
Utilisation régulière de produits chimiques pour la biologie moléculaire
Horaires parfois adaptables selon les expériences en cours

-Exigences particulières :
Respect strict des protocoles de sécurité en salle P2
Capacité à gérer plusieurs expériences en parallèle
Rigueur dans la tenue des cahiers de laboratoire