Ingénieur bioinformaticien en analyse de transcriptome et de traductome (H/F)
Nouveau
- IT en contrat CDD
- 16 mois
- BAC+5
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Type de Contrat
IT en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
91198 GIF SUR YVETTE
Durée du contrat
16 mois
Date d'Embauche
01/05/2026
Rémuneration
entre 2571 et 2742 euros bruts mensuels selon expérience
Postuler Date limite de candidature : jeudi 9 avril 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
Analyse de données de transcriptome et de traductome et mise en place d'une ressource en ligne pour la recherche en immunologie.
L'Activité
- Mettre en place des pipelines Unix d'analyse de données NGS
- Comparer des données transcriptome/traductome de différents tissus
- Assurer le respect des principes FAIR des procédures informatiques
- Déployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web)
Votre Profil
Compétences
- Connaissance des outils et concepts utilisés en analyse NGS (genome/transcriptome/proteome)
- Maîtrise des langages Python et R
- Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow
- Production de conteneurs Linux (Docker, Singularity)
- Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versions
- Anglais niveau B1
- Sens du relationnel et de la communication
- Curiosité, dynamisme,
- Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés.
Votre Environnement de Travail
Dans le cadre d'un projet financé par l'Agence de Recherche sur le Cancer (ARC) avec l'institut Curie et l'INSERM, nous étudions le transcriptome et le traductome de l'épithélium thymique, un tissu essentiel qui permet la reconnaissance du soi et du non-soi par le système immunitaire. L'ingénieur.e en bioinformatique sera en charge du traitement et de l'analyse des données NGS générées. Il/elle appliquera notamment des méthodes d'analyse sans référence, pour identifier toute la diversité des antigènes produits par ce tissu, puis comparer cette diversité à celle des autres tissus normaux. Nous exploiterons ces données pour déterminer si des antigènes de tumeur sont effectivement specifiques des tumeurs. Enfin, nous mettrons ces données à disposition de la collectivité via un service web.
L'I2BC est un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire situé dans un cadre très agréable à 25km de Paris (Gif sur Yvette). Notre équipe (Biologie computationnelle des génomes) fait partie du département de Biologie des Génomes. L'environnement bioinformatique local est très riche: forum de discussion, séminaires et formations en bioinformatique, plateforme bioinformatique et centre de calcul de haute performance.
Rémunération et avantages
Rémunération
entre 2571 et 2742 euros bruts mensuels selon expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR9198-JUDELV-007 |
|---|---|
| Secteur d’activité | Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement |
| Emploi type | Ingenieur biologiste en traitement de donnees (H/F) |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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