Missions

Le projet proposé participe à l’étude du processus d’eucaryogenèse, c’est-à-dire la complexification progressive qui a permis aux cellules procaryotes d’évoluer vers les cellules eucaryotes. Il consistera à ajouter à ces cellules procaryotes un certain nombre de gènes eucaryotes caractéristiques déjà identifiés par approche bio-informatique. Les dernières études de phylogénie ont montré que les eucaryotes ont évolué à partir d’organismes semblables aux archées Asgard actuelles. Ces dernières possèdent déjà plusieurs caractéristiques eucaryotes. Or ces Asgard sont difficilement manipulables au laboratoire. Nous utiliserons dès comme organismes récipients les archées manipulables les plus proches phylogénétiques des Asgard à savoir les archées hyperthermophiles Sulfolobales et Thermococcales. Dans le cadre de ce projet, le candidat mettra en œuvre différentes technologies de l’ADN recombinant pour introduire per transformation et exprimer des gènes identifiés ci-dessus dans un organisme hôte de l’ordre des Thermococcales. Le candidat observera ensuite les modifications phénotypiques associées à ces transformations.

Activités

• Conduire, dans le cadre d'un programme expérimental un ensemble de techniques de biologie moléculaire associées à l’ADN recombinant et à la culture de microorganismes hyperthermophiles anaérobies.
• Consigner, mettre en forme et présenter les résultats
• Gestion de mise en collection des nouveaux organismes transformés
• Appliquer les réglementations liées aux activités expérimentales
• Assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau du matériel

Compétences

• Biologie moléculaire telle que l’amplification PCR, le clonage par enzymes de restriction ou par méthode de Gibson, la mutagenèse à site dirigé, la purification de plasmides, la transformation plasmidique de bactéries ou d’archées, la culture d’archées et l’observation phénotypique des organismes transformés par microscopie optique et électronique (en collaboration).
• Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
• Langue anglaise : B1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
• Utiliser des matériels d'analyse et d'expérimentation en biologie
• Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité
• Rédiger des procédures techniques
• Gestion journalière du cahier de laboratoire
• Transmettre des connaissances

Contexte de travail

L'I2BC est une très grande unité mixte de recherche (CNRS, CEA, Université Paris-Saclay). Son effectif moyen est de 650 personnes réparties dans 5 départements scientifiques comprenant 60 équipes de recherche, 17 plateformes technologiques de haut niveau et 12 services support/soutien.

Le poste est à pourvoir dans l'équipe Biologie des Archées qui deviendra équipe Topologie de Archées (à partir du 1ER Février) et qui fait partie du département de Microbiologie
Le projet proposé fait partie d’un projet collaboratif plus large, ARCHANE financé par l’ANR. Il finance les travaux sur l’eucaryogenèse de trois équipes, l’équipe à l’I2BC qui propose ce CDD, une équipe de l’Institut Pasteur et une équipe de l’Université d’Evry-Génoscope. Ces trois équipes disposent de toutes les connaissances, technologies et équipements requis respectivement pour les archées Thermococcales, les archées Sulfolobales et l’approche bio-informatique associée à ces travaux.
Le poste est localisé à l’I2BC à Gif sur Yvette.

Contraintes et risques

Le poste demandera la manipulation d’organismes en chambre anaérobie. Ces manipulations seront toujours effectuées sous l’étroite supervision de personnels qualifiés.