H/F Ingénieur en analyse de données transcriptomiques
Nouveau
- IT en contrat CDD
- 6 mois
- BAC+3/4
Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'offre en un coup d'oeil
L'unité
Institut des Neurosciences Paris-Saclay
Type de Contrat
IT en contrat CDD
Temps de Travail
Complet
Lieu de Travail
91400 SACLAY
Durée du contrat
6 mois
Date d'Embauche
01/01/2027
Rémuneration
Entre 2 466,98 € et 3 786,43 € bruts mensuels, selon expérience professionnelle et grille des salaires du CNRS.
Postuler Date limite de candidature : lundi 26 octobre 2026 23:59
Description du Poste
Les Missions
La personne recrutée rejoindra une équipe de recherches en Neurosciences travaillant sur les circuits nerveux des mouvements chez la souris. Il.elle devra réaliser des analyses transcriptomiques sur noyaux isolés (snRNA-seq)
L'Activité
La personne recrutée pourra participer, si il.elle le souhaite, aux étapes expérimentales (tri, isoation et séquençage des noyaux). Néanmoins, le poste est ciblé sur l'analyse des données, en aval des expérimentations.
ACTIVITES A MENER EN AUTONOMIE:
- Préparation des librairies
- Contrôle qualité (doublets, contamination, intégrité des ARNs,...).
- Analyse et statistiques avec Seurat: normalisation et réduction de dimension, clustering et annotation, détection des gènes différentiellement exprimés entre conditions, intégration de jeux de données multiples.
- illustration des résulats: graphiques, barplots, dotplots, heatmaps, UMAPs...
ACTIVITES EN COLLABORATION AVEC L'EQUIPE:
- Interprétations biologiques: Comparaison de compositions cellulaires entre échantillons, hétérogénéité transcriptionnelle au sein d'une population neuronale
- Validation des résultats : croisement des marqueurs identifiés avec des bases de données anatomiques, ou des expériences d'immunomarquages ou in situ.
- Documentation et reproductibilité : rédaction de protocoles standardisés, archivage des scripts/données brutes/résultats (ex: GitHub).
- Présentation des résultats aux réunions d’équipe
- Participation à la rédaction d’articles scientifiques (ex: figures, tableaux, méthodes).
Votre Profil
Compétences
Générales :
- Formation initiale en Master 2 Bio-informatique, Biologie des Systèmes, Génomique, ou Neurosciences avec une forte composante en analyse de données.
Spécifiques :
- Connaître le principe du séquençage d'ANRm en noyaux ou cellules isolé.es.
- Bioinformatique et biostatistiques: analyse de données single-cell/single-nucleus RNA-seq, tests statistiques, visualisation des données.
- Programmation : Maîtrise de R et idéalement Seurat et Python.
- Plateformes de disséminiation des codes informatiques (ex Github).
Transversales :
- Excellente autonomie en analyse et programmation : évolution dans une équipe de neurobiologiques sans forte expertise en programmation.
- Excellente communication, capacités didactiques et de synthèse, esprit d'équipe
- Anglais professionnel (présentations d'équipes et écriture en anglais impérativement).
Votre Environnement de Travail
Le.la candidat.e rejoindra l'équipe dirigée par Julien Bouvier, circuits neuronaux et contrôle moteur, (https://neuropsi.cnrs.fr/departements/icn/equipe-julien-bouvier/), composée d’un directeur de recherche, d'un maître de conférences, d’une ingénieure d’études, d’une assistante ingénieure, de 2 postdoctorants, de deux étudiants en thèse et de plusieurs étudiants en licence et master.
Contraintes et risques
Travail à l'ordinateur.
Rémunération et avantages
Rémunération
Entre 2 466,98 € et 3 786,43 € bruts mensuels, selon expérience professionnelle et grille des salaires du CNRS.
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
| Référence de l’offre | UMR9197-JULBOU-033 |
|---|---|
| Secteur d’activité | Informatique, Statistiques et Calcul scientifique |
| Emploi type | Ingenieur statisticien (H/F) |
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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