Missions

La personne recrutée prendra en charge un projet de recherche en cancérologie ayant pour objectif d’étudier la signalisation et le réseau de régulation d’un récepteur à activité tyrosine kinase muté dans les cancers du poumon.
Plus spécifiquement, elle ou il exploitera des données de transcriptomique, traduite en réseau de régulation, pour identifier des facteurs de transcription clefs impliqués dans la transformation cellulaire induite par ce récepteur. L’implication fonctionnelle de ces acteurs sera déterminée par l’extinction de leur expression et l’analyse de réponses cellulaires variées. Des modèles expérimentaux permettront de valider leur implication dans la progression tumorale.

L’activité impliquera un travail en équipe et des interactions importantes avec le porteur du projet, les chercheurs, les ingénieurs et les étudiants de l’équipe. Des échanges avec des bio-informaticiens du campus seront importants notamment pour interpréter et implémenter le réseau de régulation des facteurs de transcription. Le projet implique également une dimension translationnelle nécessitant des interactions avec les cliniciens du CHU de Lille.

Activités

La personne recrutée aura la liberté de mettre en place les technologies et les méthodes nécessaires à la résolution de la question posée. Le projet pourra impliquer un large panel de technologies incluant de la culture cellulaire, des techniques d’analyse de l’expression des gènes (RT-qPCR) incluant des technologies haut-débit en interaction avec des plateformes de biologie moléculaire, des techniques d’analyse de l’expression des protéines (WB, IF, Co-IP), des méthodes d’extinction d’expression (siRNA, CRISPR), des techniques d’évaluation des réponses cellulaires (migration/invasion, prolifération…), ainsi que l’étude de la croissance tumorale à partir de modèles expérimentaux.
La personne recrutée devra interagir avec les différents membres de l’équipe et pourra si nécessaire encadrer des techniciens ou ingénieurs de l’équipe impliqués dans le projet. Elle pourra aussi encadrer des étudiants travaillant sur le projet.
La personne recrutée mettra en forme l’ensemble de ces résultats et rédigera les publications relatives à son activité en concertation avec le responsable du projet. Elle présentera aussi ces résultats dans les séminaires locaux et des congrès nationaux et internationaux.

Compétences

-Culture cellulaire
-Compétences en biologie moléculaire (clonage en vecteur d’expression). Préparation de plasmides. Des compétences en édition du génome seraient un plus.
-Techniques d’analyse de l’expression des protéines par Western blot, immunofluorescence, cytométrie en flux, immunoprécipitation. Techniques d’analyse de l’expression des gènes (RT-qPCR) t en haut débit en intéraction avec les plateformes locales de biologie moléculaires (3’RNA-Seq, ATAC-Seq).
-Modèles expérimentaux de tumorigenèse in vivo (le niveau I serait un plus).
-Connaissances sur la signalisation intracellulaire et notamment sur les récepteurs à activité tyrosine kinase. Connaissances sur les principes fondamentaux de la tumorigenèse.
-Capacités de travail en équipe et d’encadrement.
-Capacités à organiser son travail de façon autonome et d’acquérir rapidement de nouvelles techniques requises pour le projet.
-Connaissances des outils informatiques de mise en forme des résultats et des outils statistiques.
-Capacités à rédiger un article scientifique en Anglais sur la base des résultats obtenus.
-Capacités à présenter des résultats dans des congrès nationaux et internationaux.

Contexte de travail

La personne recrutée travaillera dans une des équipes de recherche de l’unité CANTHER au sein de l’institut de recherche ONCOLille dont l’activité est dédiée à la lutte contre le cancer. Elle ou il travaillera sous la direction du chef d’équipe également responsable scientifique du projet. Les plateformes technologiques Lilloises en biologie et santé seront à la disposition de la personne recrutée dans la limite du budget alloué au projet.

Contraintes et risques

Travail en laboratoire de recherche