Missions

Mise au point d’outils pour la visualisation graphique et l’interprétation de l’analyse des répertoires exprimés des Immunoglobulines (IG) et des récepteurs T (TR), récepteurs d’antigènes des cellules B et T respectivement.
Les répertoires analysés à visualiser seront issus des résultats d’IMGT/HighV-QUEST, le logiciel d’IMGT® (the international ImMunoGeneTics information system®, https://www.imgt.org/), dédié à l’analyse haut-débit des séquences réarrangées IG et TR de l’homme et autres espèces de vertébrés.

Activités

- Développement d’outils de visualisation des données des répertoires exprimés des IG et TR de cellules B et T.
- Amélioration d’outils d’analyse des données tel que IMGT/StatMutations, dédié à la caractérisation des mutations somatiques dans les séquences IG.
- Intégrer ces outils avec des outils d’IMGT déjà existant tel que IMGT/HighV-QUEST
- Diffuser et valoriser les résultats.
- Travaille en équipe et interactions avec des biologistes et bio-informaticiens.

Compétences

- Compétences en programmation dans les langages JavaScript et R
- Connaissance en bash et python
- Connaissance souhaitable en shiny
- Compétence en visualisation des données
- Analyse de gros jeux de données
- Connaissances en immunogénétique serait un plus
- Bonne maîtrise de l'anglais
- Aptitude à travailler en équipe

Contexte de travail

https://www.imgt.org/

Contraintes et risques

Travail sur ordianteur.