Missions

La personne recrutée sera impliquée dans un projet de recherche multidisciplinaire visant à étudier le rôle des structures secondaires de l’ARN dans le contrôle de l’épissage alternatif. Elle prendra en charge les expériences visant à démontrer la formation de structures secondaires de l’ARN in vitro par des méthodes biophysiques (CD, TDS, UV-melting, gels d’électrophorèse, RMN), l’effet de ligands sur la stabilité de ces structures et l’équilibre entre elles, ainsi que les expériences de sondage chimique (SHAPE) visant à établir la structure secondaire de transcrits longs de l’ARN en présence de différents ligands et dans diverses conditions. L’ingénieur participera également à l’analyse et à l’interprétation de données, en étroite collaboration avec les autres équipes impliquées dans ce projet.

Activités

- Effectuer les études biophysiques d’oligonucléotides d’ARN par des techniques biophysiques : CD, TDS, gels d’électrophorèse, UV- et FRET-melting, RMN.
- Réaliser les transcriptions in vitro.
- Mettre au point, effectuer et analyser les expériences de sondage chimique (SHAPE) adaptées à la séquence d’intérêt de l’ARN.
- Analyser et interpréter les résultats.
- Tenir un cahier de laboratoire.
- Rédiger et actualiser des protocoles techniques.
- Participer aux tâches communes du laboratoire.
- Analyser et présenter les résultats lors des réunions des equipe impliquées dans le projet.

Compétences

- Bonnes connaissances en chimie et biochimie d’acides nucléiques.
- Maitrise des techniques de biochimie et de biophysique moléculaire : gels d’électrophorèse (PAGE, agarose), spectroscopie moléculaire (UV/Vis, CD, fluorescence, RMN).
- Manipulations de produits chimiques (ligands de l’ADN et de l’ARN, réactifs pour le sondage chimique, tampons).
- Maitrise des techniques de biologie moléculaire : transcription in vitro, RT-PCR.
- Exploration et veille bibliographique.
- Capacité d'organisation et d'adaptation.
- Travailler en équipe et dans un environnement pluridisciplinaire.
- Utilisation des outils informatiques d'analyse, de mise en forme et d'enregistrement des données.
- Très bonne maitrise de l'anglais (compréhension écrite et orale, rédaction de protocoles).
- Suivi de l’évolution des règles d’hygiène et de sécurité et veille à leur application en liaison avec l’Assistant de prévention.

Contexte de travail

L’équipe d’accueil « Des nouvelles méthodes de synthèse pour l’interface chimie–biologie » fait partie de l’unité UMR8601 CNRS « Laboratoire de chimie et biochimie pharmacologiques et toxicologiques » situé à l’Université Paris Cité (Paris 6ème). Les intérêts de l’équipe couvrent un large éventail de sujets dans les domaines de la chimie organique synthétique et de la biologie chimique, tous étant fondés sur l'innovation moléculaire. Nos travaux impliquent l'exploration de nouveaux espaces chimiques ainsi que le développement d'outils synthétiques ou de méthodes analytiques pour étudier et/ou interférer avec les mécanismes de régulation biologique.
Le poste proposé s’inscrit dans le cadre d’un projet financé par l’Institut National du Cancer et consacré à l’étude du rôle de structures secondaires de l’ARN dans le contrôle de l’épissage alternatif, mené en collaboration avec les équipes à l’Université de Bretagne Occidentale (Brest) et le CRCI2NA (Nantes).

Contraintes et risques

Le poste comporte une exposition aux risques chimiques et biologiques dont la gestion sera prise en charge selon les modalités du cadre national et le règlement intérieur du laboratoire.