Informations générales
Intitulé de l'offre : Post-doctorat (H/F)- Rôle de la dynamique moléculaire dans la régulation de la transcription: microscopie et modélisation
Référence : UMR8523-LAUHEL-003
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLENEUVE D ASCQ
Date de publication : mercredi 6 septembre 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 novembre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2 690,42 et 3 993,12 euros bruts /mois selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Micro et nanotechnologies, micro et nanosystèmes, photonique, électronique, électromagnétisme, énergie électrique
Missions
le/la Post-doctorant(e) sera impliqué dans l'ANR ABC4M et aura pour mission de réaliser les études par microscopie multi-modale de la dynamique de la régulation de la transcription par le complexe PTEFb,
Activités
- Travail sur cellules vivantes marquées en fluorescence - Microscopie et mesure des dynamique et interactions moléculaire par FRET, FCS, SPT - Mise ne place d'un dispositif de mesure multiplexe - Réalisation des campagnes expérimentales - Analyse des données et développent des méthodes associées - Contribution au développement des méthodes de modélisation - Présentation des résultats - Publications
Compétences
- Autonomie et organisation dans le travail - Travailler en équipe - Autonomie en microscopie - Connaissance en biologie cellulaire de base
Contexte de travail
Le/la post-doctorant(e) travaillera au sein de l'équipe interdisciplinaire Dysco dans le groupe de L.Heliot dans le cadre du projet ANR ABC4M en collaboration avec les équipes de Hugues Berry (INRAE, Lyon); Ignacio Izeddin (Inst. Langevin, Paris), Xavier Darzacq (Berkeley Univ, USA). Ce projet ABC4M propose de coupler des expériences et des simulations informatiques pour analyser le mouvement des composant du complexe P-TEFb dans les cellules vivantes à plusieurs échelles temporelles. Nous effectuerons des mesures du mouvement de P-TEFb dans le noyau de cellules vivantes à des échelles spatio-temporelles disjointes (FCS et SPT) et interpolerons ces observations en utilisant une approche de calcul bayésien approximatif (ABC) avec des simulations Monte-Carlo de la diffusion de P-TEFb comme modèle statistique utilisée pour ajuster les données. Les paramètres déduits de l'ABC nous fourniront une quantification multi-échelle des données expérimentales et nous aideront à résoudre les décalages potentiels entre les différents modes de microscopie. Nous appliquerons également la sélection de modèles basée sur l'ABC pour déterminer l'implication respective de chaque mécanisme microscopique (encombrement moléculaire, liaison, condensats en phase liquide...) dans la diffusion non standard de P-TEFb. Afin de fournir une image compréhensible de la danse moléculaire orchestrée qui a lieu dans le noyau lors de la libération de la pause, nous tenterons d'interpréter les observations expérimentales de la dynamique de P-TEFb dans des conditions contrôlées ou perturbées (mutants génétiques, interférence ARN, drogues pharmacologiques).