Chercheur postdoctoral H/F - Modifications des ARNt et adaptation au stress chez des souches cliniques d’Escherichia coli

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Expression Génétique Microbienne

PARIS 05 • Paris

  • Chercheur en contrat CDD
  • 12 mois
  • Doctorat

This offer is available in English version

Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.

L'offre en un coup d'oeil

L'unité

Expression Génétique Microbienne

Type de Contrat

Chercheur en contrat CDD

Temps de Travail

Complet

Lieu de Travail

75005 PARIS 05

Durée du contrat

12 mois

Date d'Embauche

01/11/2026

Rémuneration

Fourchette 2600 à 3600 eur mensuel selon l'expérience

Postuler Date limite de candidature : vendredi 25 septembre 2026 23:59

Description du Poste

Les Missions

La personne recrutée aura pour mission d’étudier l’impact des modifications post-transcriptionnelles des ARN de transfert (ARNt) sur la tolérance et l’adaptation au stress de souches cliniques d’Escherichia coli.
Le projet combinera microbiologie expérimentale, génétique bactérienne, approches CRISPRi et analyses bioinformatiques afin d’identifier les déterminants moléculaires et génétiques impliqués dans les variations de réponse au stress entre souches. La personne recrutée assurera notamment le lien entre caractérisation phénotypique, perturbation génétique et analyse comparative des génomes.

L'Activité

• Culture et manipulation de souches cliniques d’Escherichia coli.
• Construction de souches bactériennes mutantes et de plasmides.
• Construction, manipulation et/ou exploitation de banques de souches, notamment par approches CRISPRi.
• Mise en place de tests phénotypiques permettant d’évaluer la croissance, la survie et la tolérance des souches à différents stress, en particulier aux stress antimicrobiens.
• Réalisation de techniques de microbiologie, génétique bactérienne et biologie moléculaire.
• Analyse de génomes bactériens et comparaison de génomes issus de différentes souches.
• Analyse bioinformatique de données génomiques et identification de variations génétiques associées aux phénotypes observés.
• Intégration, analyse statistique et visualisation de données génomiques et phénotypiques.
• Interprétation des résultats expérimentaux et bioinformatiques dans le contexte de l’adaptation bactérienne au stress.
• Participation à la rédaction de publications scientifiques et à la présentation des résultats.

Votre Profil

Compétences

• Doctorat en microbiologie, génétique bactérienne, biologie moléculaire, génomique ou domaine apparenté.
• Solide expérience expérimentale en microbiologie bactérienne.
• Expérience confirmée en génétique bactérienne et en construction de souches.
• Expérience dans la construction et/ou l’utilisation de banques de souches par approches CRISPRi.
• Maîtrise des techniques courantes de biologie moléculaire.
• Expérience en analyse de génomes bactériens et en génomique comparative.
• Compétences en bioinformatique appliquée à l’analyse de données génomiques.
• Expérience en analyse et visualisation de données, notamment sous R et/ou Python.
• Capacité à intégrer des données expérimentales, génomiques et phénotypiques.
• Intérêt marqué pour les mécanismes d’adaptation bactérienne au stress, la tolérance aux antimicrobiens et la régulation de la traduction.
• Une expérience sur des souches cliniques d’Escherichia coli constitue un atout important.
• Autonomie expérimentale, rigueur, esprit critique et capacité à contribuer à l’orientation scientifique du projet.
• Bonne maîtrise de l’anglais scientifique écrit et oral.

Votre Environnement de Travail

La personne recrutée rejoindra l’équipe « Réponses épitranscriptionnelles au stress antimicrobien », dirigée par Zeynep Baharoglu, au sein du Laboratoire d’Expression Génétique Microbienne de l’Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC), à Paris.
Les recherches de l’équipe portent sur les mécanismes moléculaires permettant aux bactéries de s’adapter aux stress environnementaux et antimicrobiens, avec un intérêt particulier pour les modifications post-transcriptionnelles des ARN et leur rôle dans la régulation de la traduction.
Le projet portera plus spécifiquement sur l’étude de souches cliniques d’Escherichia coli et combinera approches de microbiologie, génétique bactérienne, CRISPRi, génomique comparative et bioinformatique.
La personne recrutée travaillera en interaction étroite avec les membres de l’équipe et les collaborateurs impliqués dans les analyses génomiques et bioinformatiques.

Contraintes et risques

• Travail expérimental en laboratoire de microbiologie BSL2.
• Manipulation de souches cliniques d’Escherichia coli dans les conditions de confinement et de sécurité réglementaires adaptées.
• Manipulation de microorganismes génétiquement modifiés.
• Respect strict des règles d’hygiène, de sécurité et des procédures applicables à la manipulation de microorganismes.
• Utilisation courante d’équipements et de réactifs de biologie moléculaire et de microbiologie.

Rémunération et avantages

Rémunération

Fourchette 2600 à 3600 eur mensuel selon l'expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR8261-ZEYTAD-002
Section(s) CN / Domaine de recherche Biologie moléculaire et structurale, biochimie
Expérience souhaitée 1 à 4 années

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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Chercheur en contrat CDD • 12 mois • Doctorat • PARIS 05

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