Missions

Le/la candidat(e) travaillera dans l'équipe Physiologie et Régulation de la Synthèse Protéique au sein de l'unité « Expression Génétique Microbienne » à l'Institut de Biologie Physico-Chimique, Paris 5éme. Le laboratoire travaille sur la caractérisation de facteurs de régulation de la biosynthèse des protéines en utilisant des méthodes génétiques, biochimiques et structurales. Le/la candidat(e) assurera la mise en œuvre, dans le cadre d'un protocole établi, de techniques de biologie moléculaire et de biochimie pour la préparation, la caractérisation et l'étude d'échantillons ribosomiques.

Activités

• Conduite d'expériences courantes de biologie faisant appel essentiellement à des techniques biochimiques et de biologie moléculaire :
- Biochimie : purification de protéines sur colonne d'affinité et FPLC, électrophorèse SDS-PAGE, Western–blots, tests d'activité in vitro, dosages biologiques et/ou biochimiques ;
- Biologie moléculaire des procaryotes : clonage, PCR, préparation d'ADN et d'ARN,
- Préparation d'échantillons d'ARN et contrôle de leur qualité
- Réactions de traduction in vitro
- Préparation de complexes ribosomiques pour la résolution de leurs structures par cryo-microscopie électronique (collaboration).
• Tenir un cahier d'expérience et rendre compte de son activité
• Suivre l'évolution des techniques du domaine d'activité. Appliquer et adapter des protocoles techniques.
• Formaliser et actualiser l'ensemble des protocoles techniques utilisés au sein de l'équipe.
• Surveiller les appareillages en assurer la maintenance de premier niveau.
• Gérer les stocks et les commandes courantes du groupe.
• Gérer la banque de souches du laboratoire.
• Participer à la formation technique des stagiaires et étudiants.
• Appliquer et faire appliquer les règles de sécurité au sein de l'équipe.

Compétences

• Connaissance générale de la biologie particulièrement des processus de traduction de l'ARNm.
• Une expérience en préparation d'échantillons d'ARN, de protéines, de ribosomes est requise.
• des connaissances affirmées en :
1- Microbiologie: culture de souches bactériennes et expression de protéines chez E. coli.
2- Biologie moléculaire : construction de plasmides pour l'expression de protéines et de rapporteurs génétiques, synthèses d'ARNm et purification.
3- Biochimie : Purification de protéines et de complexe ARN/protéines par chromatographie d'affinité et d'exclusion de taille
• des connaissances techniques sur les appareils et l'analyse informatique des résultats:
1- Utiliser les appareillages dédiés nécessaires (électrophorèses, chromatographie, microscope, spectrophotomètre, pH-mètre...).
2- Utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats: PowerPoint, Word, Excel, logiciels de comparaison de séquences, Image J….
• Notions de base en mathématiques, en physique et en chimie.
• Savoirs sur l'environnement professionnel : risques et règles d'hygiène et de sécurité.
• Autonomie.
• Rigueur, sens de l'organisation et goût du travail minutieux.
• Esprit de synthèse et d'analyse.
• Souplesse et adaptabilité.
• Goût du travail en équipe et de l'interaction avec des personnels très variés (chercheurs, étudiants, invités étrangers...)
• Anglais : Compréhension écrite et orale : niveau I

Contexte de travail

Le laboratoire « Expression Génétique Microbienne » (EGM, UMR8261 CNRS-Université Paris Cité) développe des projets de recherche ayant pour objectif l'étude fondamentale de l'expression génétique des micro-organismes (E. coli, B. subtilis, Synechocystis et S. cerevisiae) par des approches génétiques, biochimiques et structurales. L'ARN, sous toutes ses formes, joue un rôle central dans nos travaux qui concernent les étapes clés dans le contrôle de l'expression génétique : la transcription des gènes, la stabilité des ARNm et leur traductibilité. Cette unité compte trente-cinq personnes réparties en cinq équipes scientifiquement autonomes. La personne recrutée s'impliquera dans la préparation d'échantillons permettant la résolution de structures de complexes ribosomique associés à des protéines de la famille ABC-F qui sont impliquées dans la régulation de la traduction et la résistance aux antibiotiques. La personne sera encadrée par le responsable de l'équipe, Gregory Boël, et une maître de conférence d'Université Paris Cité.

Contraintes et risques

Il est possible que le/la candidat(e) soit amené à utiliser des radio-isotopes.