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Position postdoctoral de 2 ans (H/F): Régulation de la synthèse des protéines par les facteurs de traduction ABC-F et protection contre des antibiotique

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : mardi 3 novembre 2020

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Informations générales

Référence : UMR8261-GREBOE-004
Lieu de travail : PARIS,PARIS 05
Date de publication : mardi 13 octobre 2020
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Salaire brut entre 2728,26 et 3145, 68 €, selon expérience
Niveau d'études souhaité : Supérieur à bac+5
Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Un poste postdoctoral de deux ans débutant en début janvier 2021 est ouvert dans le groupe de recherche de Grégory Boël à l'Institut de biologie physico-chimique (IBPC), dans l'unité "Expression Génétique Microbienne".

Activités

Nous avons montré que les protéines appartenant à la famille ABC-F étaient des facteurs de traduction qui modulaient l'activité des ribosomes (Ousalem et al, 2019 ; Boël, et al. ; Chen, et al.). Certaines protéines ABC-F sont impliquées dans l'adaptation bactérienne à leur environnement, mais d'autre protéines ABC-F spécifiques sont impliquées dans la résistance aux antibiotiques. Leur implication dans la résistance aux antibiotiques est médiée par l'interaction directe du facteur ABC-F avec le ribosome (Crowe-McAuliffe, et al., Murina, et al.), mais le mécanisme d'action reste toujours élusif. Nous proposons d'étudier cette question en déterminant les résidus essentiels au fonctionnement d'un ABC-F impliqué dans la résistance aux antibiotiques par une approche de mutagenèse et de ciblage en haut débit. D'autre part le projet visera aussi à étudier la fonction des deux protéines ABC-F de la bactérie photosynthétique Synechocystis. Le la candidat·e sera en charge de l'analyse transcriptomique (RNAseq) et protéomique (Masse spectrométrie en tandem) des mutants de délétion de chacun des deux gène ABC-F et des souches complémentées (les souches sont déjà construites). Suivra le développant de la méthode de profilage de ribosome sur les ARNm (ribo-seq) chez cet organisme. Note groupe a mis au point un dispositif expérimental permettant d'étudier simplement les ABC-F in vivo et in vitro.

Ousalem F, et al., Res Microbiol. 170(8):435-447. (2019)
Boël G., et al. Nat. Struct. Mol. Bio. 21:143-151 (2014)
Chen B., et al. Nat. Struct. Mol. Bio. 21:152-159 (2014)
Crowe-McAuliffe C, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 115(36):8978-8983 (2018)
Murina V, et al. Nucleic Acids Res. 46(7):3753-3763. (2018)

Compétences

Nous recherchons une ou un candidat·e hautement motivé·e avec un doctorat dans tous les domaines de la microbiologie (génétique, biologie moléculaire, biochimie, bio-informatique). La ou le candidat·e idéal·e devrait être familiarisé·e avec la synthèse des protéines, la biochimie de l'ARN et des approches par séquençage haut débit.

Une bonne connaissance de la génétique des cyanobactéries et des méthodes d'analyse par séquençage haut débit mRNA-seq et/ou ribo-seq (préparation des échantillons, construction des libraires et analyse des résultats) est nécessaire pour appliquer à cette position.

La ou le candidat·e retenu·e doit être un·e scientifique motivé·e, doté·e d'un grand potentiel et d'un bon esprit d'équipe.

Les candidat·e·s doivent soumettre sur le site emploi du CNRS leur CV avec la liste complète de leurs publications ainsi que trois références pouvant être contactées.
Pour avoir des informations complémentaires le ou la candidat(e) peut contacter Grégory Boël à boel@ibpc.fr

Contexte de travail

La plupart des travaux expérimentaux seront effectués par la ou le candidat·e à l'IBPC dans le groupe de G. Boël. L'IBPC est un institut multidisciplinaire du Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) situé dans le centre de Paris sur le campus Pierre et Marie (Paris 5éme). L'institut possède une plateforme de protéomique et de bioinformatique qui seront sollicitées pour ce projet.

Contraintes et risques

Il est possible que ce projet de recherche implique l'utilisation de radio isotope

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