Missions

L'agent (H/F) aura pour missions principales d'adapter et appliquer des approches de microbiologie, biochimie et biologie moléculaire pour l'étude de bactéries marines capables de dégrader les polyphénols d'algues brunes et la caractérisation de leurs enzymes.

Activités

Tâches principales :
- Collecte d’échantillons biologiques (algues, biofilms, fractions microbiennes de l'eau de mer)
- Extraction préparative et quantification des polyphénols à partir d'algues brunes
- Enrichissements et cultures bactériennes en présence des polyphénols
- Suivis de croissance en milieu liquide (densité optique, cytométrie)
- Isolement, mise en collection et caractérisation de nouvelles souches bactériennes marines
- Extraction et préparation des ADN/ARN issus d’échantillons marins
- Fractionnement des acides nucléiques sur gradient de densité
- Réalisation de réactions de séquences, PCR, qPCR et RT-qPCR
- Clonage et expression hétérologue de protéines d'intérêt chez E. coli
- Purification de protéines recombinantes
- Tests enzymatiques

Tâches secondaires
- Participation au suivi des analyses de données et présentation des résultats
- Participation à la gestion des stocks et de produits consommables au laboratoire

Compétences

- Compétences solides en microbiologie (cultures bactériennes, isolements) et en biologie moléculaire (clonage, PCR, séquençage)
- Maîtrise des techniques de biochimie, de préparation et d'analyse d'échantillons biologiques
- Connaissances en expression hétérologue de protéines
- Une expérience en microbiologie marine serait un avantage
- Rigueur, autonomie et sens de l'organisation
- Savoir lire et comprendre l'anglais technique

Contexte de travail

Situé à la Station Biologique de Roscoff, le Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins (LBI2M) regroupe environ 85 personnes. La recherche menée dans l'unité LBI2M intègre des approches interdisciplinaires et multi-échelle (du gène à la population) pour mieux comprendre les interactions des organismes entre eux et avec leur environnement. Cette évolution implique l'étude de communautés microbiennes associées (ou non) aux organismes multicellulaires étudiés dans l'unité́ (algues et invertébrés) ou holobionte. En même temps, l'étude génétique et phénotypique de bactéries marines modèles s'est développée, pour pouvoir comprendre leurs fonctions biologiques au sein de communautés complexes. Le poste proposé s'inscrit dans le projet de recherche MICROPHLOR porté par François THOMAS et récemment financé par l'ADEME (2025-2029). Le projet vise à identifier et caractériser de nouvelles bactéries marines capables de dégrader les phlorotannins, des polyphénols spécifiques chez les algues brunes. Le poste sera affecté à l'équipe BABIM (Bacterial Bioconversion of Macroalgae) sous la responsabilité de François THOMAS. Les missions impliquent des collaborations avec l'équipe ABIE et le CMAR (Centre de Mutualisation et d'Appui à la Recherche) du LBI2M, les plateformes technologiques de la FR2424 et l'entreprise AberActives.