Missions

Le post-doctorant (H/F) sera responsable de l'analyse des données métagénomiques d'une série temporelle unique de communautés de microorganismes marins. L'ensemble des données couvre plus de 10 ans à une fréquence d'échantillonnage allant jusqu'à deux fois par semaine. Le post-doctorant (H/F) développera des sujets de recherche sur, entre autres, la saisonnalité des voies métaboliques et l'écologie des interactions microbiennes. Il ou elle collaborera avec une équipe européenne travaillant sur la modélisation des communautés, du plancton aux bactéries, en relation avec la télédétection.

Activités

Construction de table d'abondance de gènes, MAG, gestion de données, analyses statistiques, rédaction, présentations, et autre selon compétences.

Compétences

Le post-doctorant (H/F) retenu devra avoir une solide expérience dans l'analyse de données métagénomiques (reconstruction de MAG, construction de tables d'abondance de gènes...) et une capacité à analyser de grands jeux de données. Une bonne connaissance de l'écologie et des biostatistiques serait un atout. Une connaissance préalable de l'écologie microbienne marine n'est pas un pré-requis.

Contexte de travail

Le laboratoire d'accueil est situé à l'Observatoire Océanologique de Banyuls (OOB) dans le sud de la France. L'OOB est une station de recherche ayant une forte expérience dans le domaine des sciences marines. C'est une institution dynamique qui attire chaque année un grand nombre d'étudiants et de chercheurs invités. Elle fait partie de Sorbonne Université, l'une des principales universités françaises, et du CNRS, un acteur clé de la recherche internationale. Les travaux seront coordonnés par Pierre Galand et François Yves Bouget dans le cadre du projet européen PETRI-MED.