Ingénieur de recherche (H/F) pour le développement de l'imagerie de fluorescence super-résolue par détection oblique pour la biologie

Job Description

Missions

Dans le cadre de ce poste, il s'agira de contribuer au développement d'un nouveau dispositif de microscopie optique super-résolu) pour des applications biologiques. En particulier, dans le cadre du projet, il s'agira de mettre en place une détection originale, basée sur la mise en place de dispositif de reimagerie oblique type OPM (Oblique Plane Microscopy). Ce travail s'incrit dans un cadre étant interdisciplinaire (optique, électronique, traitement d'images (deep learning), traitement du signal, informatique, chimie, biologie), la personne recrutée sera plus particuliérement en charge de la partie optique tout en travaillant en synergie avec le reste de l'équipe sur les autres domaines.

Activity

La personne contribuera dans le cadre du projet à :
- développer une nouvelle implémentation de la détection du microscope super-résolu via un dispositif de reimagerie utilisant un objectif de type snouty
- contribuer au développement d'outils de traitement de données/images, pouvant mobiliser des approches de deep learning
- de contribuer à la programmation de l’expérience et à la réalisation d'outils de simulation
- de tester sur différentes applications biologiques, notamment sur des objets complexes tels que des organoïdes
- de développer de nouvelles approches de calibration et de marquage des échantillons par DNA-PAINT
- de rédiger des rapports d'avancement et des articles
- de participer à des conférences nationales et internationales

Your Profil

Skills

Des compétences techniques sont attendues dans le domaine de l'optique/physique, ainsi qu'idéalement des connaissances dans la programmation en python.
La personne recrutée aura idéalement une expérience précédente dans le développement ou l'utilisation d'un microscope de fluorescence appliquée à des problématiques biologiques.
La personne recrutée devra pouvoir partager régulièrement sur son travail et montrer un intérêt pour le travail en équipe et l'interdisciplinarité.

Your Work Environment

Ce travail se fera au sein de l'équipe Nanobio de l'ISMO (Unité Mixte CNRS / Université Paris-Saclay) dans le cadre de différents projets européens en collaboration avec des équipes européennes et l' entreprise Abbelight. L'équipe Nanobio développe de nouvelles modalités de microscopie de fluorescence permettant de repousser les limites de ces observations aussi bien en termes de vitesse d'acquisition que de profondeur d'observation pour des applications allant de la biologie à l'étude de nanomatériaux. Ces développements sont au croisement de différentes disciplines et mettent en jeu des compétences allant de l'optique, l'électronique, le traitement des images/data, la chimie et la biologie, et s'adresse donc en particulier à des candidats souhaitant travailler au cœur de cette interdisciplinarité avec une formation dans l'un de ces items majeurs, et souhaitant découvrir les items connexes. Le laboratoire dispose de différents microscopes pour la localisation de molécule unique, ainsi que l'accès à différents équipements communs (laboratoire de culture cellulaire L1/L2, atelier mécanique/électronique) pour mener à bien l'ensemble du projet.

Constraints and risks

- faisceau laser
- culture cellulaire

Compensation and benefits

Compensation

Salaire mensuel en fonction de l'expérience, compris entre 3237,95 € et 3505,53 € brut

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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