Missions

L'équipe Nanobio développe de nouveaux concepts permettant de repousser les limites de l'imagerie de fluorescence super-résolue, et ce projet s'adresse en particulier à un candidat souhaitant intégrer un projet interdisciplinaire qui nécessite la convergence de différentes expertises à haut niveau. Dans le cadre de ce poste, il s'agira de développer les approches de traitement de signal associées au nouveau concept de localisation de molécules uniques récemment breveté et validé expérimentalement. Nous avons mis en place une nouvelle modalité d'illumination structurée qui permet d'encoder la position des molécules fluorescentes avec une fréquence d'illumination unique, ce qui permet donc d'observer un champ large sur un monodétecteur (seul ou en matrice éventuellement en association avec des FPGA). Dans le cadre du projet, il s'agira de développer des outils d'analyse/traitement du signal issu de ces détecteurs et permettre d'augmenter le nombre de molécules et donc de fréquences pouvant être détectées de façon simultanée, et également de pouvoir grâce à ces analyses contribuer à l'optimisation des paramètres expérimentaux. Idéalement, des outils permettant de tendre vers une analyse temps réel seront développés. Ces outils d'analyse pourront mobiliser des approches de deep learning. Après une phase de tests sur des échantillons de calibration, ces outils seront appliquées à l'observation d'échantillons biologiques en collaboration avec différents membres de l’équipe. Ces nouveaux développements seront mis en place dans le cadre de l'ERC TimeNanoLive.
Le poste pourra être prolongé d'une nouvelle période de 12 mois.

Activités

La personne contribuera à différents aspects :
- mise en place des nouveaux outils d'analyse
- programmation pilotage/simulation
- tests et validation sur différents set de datas de calibration
- caractérisation sur différents échantillons
- rédaction d'articles
- participation à des conférences

Compétences

- traitement du signal
- connaissances en optique/microscopie
- savoir travailler en équipe
-curiosité pour le travail interdisciplinaire

Contexte de travail

Ce travail se fera au sein de l'ISMO (Unité Mixte CNRS / Université Paris-Saclay) dans le cadre d'un projet européen ERC TimeNanoLive. Le laboratoire dispose d'une salle de culture sur site et de différents microscopes pour la localisation de molécule unique.

Contraintes et risques

- faisceau laser
- culture cellulaire

Informations complémentaires

ERC TimeNanoLive