Missions

L'ingénieur (H/F) aura pour mission la mise en œuvre des différents outils bioinformatiques nécessaires à l’analyse des suivis de populations de microalgues du phytoplancton infectées par des prasinovirus. Il/elle mettra également en œuvre les outils de biologie moléculaire nécessaires à la validation des fonctions des gènes candidats impliqués dans la résistance des microalgues aux virus.

Activités

- Annotation de génomes et des transcriptomes (données Nanoporeet Illumina)
- Microscopie confocale pour l’implémentation du protocole HCR pour l’estimation du pourcentage de cellules infectées
- Protocoles de transformation des microalgues
- Cultures de microalgues et suivi de l’évolution de la résistance aux virus

Compétences

- Connaissances solides en bioinformatique (analyses NGS, assemblage, annotation, programmation R, méthodes de génomique comparative)
- Expertise en biologie moléculaire (HCR, transformation)
- Expertise en phycologie et en virologie
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique
- Autonomie, rigueur, et ouverture d’esprit
- Capacité de communication

Contexte de travail

Le poste sera affecté à l’UMR8176, Biodiversité et Biotechnologie Marine (LBBM), qui fait partie de l’observatoire océanologique de Banyuls sur mer. L’unité LBBM compte une trentaine de personnes qui s’intéressent à des questions biologiques variées, dont la génomique évolutive et environnementale du phytoplancton et des virus associés.
La personne recrutée participera activement aux projets développés dans le cadre des bases moléculaires de la résistance des microalgues aux prasinovirus au sein de l’axe GENOPHY.