Informations générales
Intitulé de l'offre : Offre de postdoctorat – Enrichissement en culture et caractérisation des consortia symbiotiques d’archées (H/F)
Référence : UMR8079-PURLOP-007
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : jeudi 17 octobre 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 3081,33 et 3519,85 € euros bruts si expérience inférieure à 2 ans ; 4 291,70 € si expérience 2-6 ans
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Interactions, particules, noyaux du laboratoire au cosmos
Missions
Les bactéries et les archées vivant dans des environnements pauvres en oxygène établissent souvent des symbioses métaboliques ou syntrophies avec d’autres partenaires procaryotes pour exploiter des niches écologiques spécifiques. Les consortia d’archées méthanotrophes anaérobies et des bactéries sulfato-réductrices ou, plus récemment, des consortia d’archées Asgard et de deltaprotéobactéries sulfato-réductrices et/ou d’archées méthanogènes, en sont des exemples. Toutefois, la plupart des symbioses dans des environnements pauvres en oxygène restent peu explorées et la spécificité et le niveau d’interdépendance des lignées partenaires inconnues. Dans ce projet, on vise à enrichir/isoler ou caractériser des consortia symbiotiques d’archées appartenant à des lignées méconnues dans des environnements à transition redox, telles les archées Asgard, avec d’autres partenaires procaryotes. On combinera des approches culturelles sous des conditions anaérobies avec des techniques microscopiques diverses et des approches moléculaires/génomiques afin d’identifier les partenaires et inférer la nature de leurs interactions physiques et métaboliques. Des consortia symbiotiques potentiellement isolés seront utilisés pour tester les prédictions génomiques, déterminer la physiologie des partenaires et leur interdépendance sous différentes conditions.
Activités
- Enrichir/isoler en culture des consortia symbiotiques d’archées avec d’autres partenaires bactériens et/ou archéens à partir d’environnements pauvres en oxygène
- Caractériser par microscopie la morphologie et (ultra)structure des microorganismes en culture
- Identification moléculaire/génomique des lignées phylogénétiques des microorganismes enrichis
- Etude de la physiologie et la bioénergétique des microorganismes en co-culture
Compétences
- Ample connaissance et de l’expertise en microbiologie classique, culture de procaryotes anaérobies ; expérience en bioreacteurs appréciée
- Bonne connaissance en métabolisme et bioénergétique des microorganismes
- Expérience en techniques microscopiques
- L’expérience en techniques d’hybridation fluorescente in situ ainsi que des analyses de phylogénie moléculaire et/ou génomiques sera fortement appréciée
- Expérience en analyses de phylogénie moléculaire et génomique souhaitables.
- La personne recrutée devra être fluide en langue anglaise (écrite, parlée)
- Bonnes capacités de présentation et communication, autonomie, organisation et esprit critique
Contexte de travail
Cette offre est financée par le projet ERC AdG SYMBEK. La personne recrutée intègrera l’équipe DEEM –Diversité Ecologie et Evolution Microbiennes (http://www.deemteam.fr/en/). Notre laboratoire est situé dans le nouveau campus de l’Université Paris-Saclay, environ 30 km au sud de Paris. Un train de banlieue connecte avec Paris.
Contraintes et risques
Le travail de postdoc implique la manipulation de cultures en anaérobiose et l’application de techniques de biologie moléculaire et microscopie, ainsi qu’une partie de travail bioinformatique. Le travail sera réalisé sous les règles de sécurité normative.