Missions

L’assistant.e ingénieur recruté.e sera chargé.e de la mise en place et de la gestion d’une collection de souches bactériennes algicides, en combinant diverses approches expérimentales.

Activités

Activité 1 : cultures phytoplanctoniques et bactériennes
o Préparation de milieux solides et liquides (pour culture phytoplanctonique et bactérienne)
o Maintien d’une collection de souches phytoplanctoniques

Activité 2 : criblage de la Banyuls Bacteria Culture Collection (BBCC)
o Mise en culture des différentes souches dans des milieux de culture variés, cryopréservation
o Mise en co-culture avec des souches phytoplanctoniques, suivi des populations phytoplanctoniques au cours du temps
o Analyse des données, présentation et discussion des résultats au sein de l’équipe

Activité 3 : isolement spécifique de bactéries algicides
o Tests et mise au point des protocoles (en collaboration avec les membres de l’équipe)
o Isolements bactériens, tests fonctionnels, cryopréservation

Activité 4 : gestion du matériel
o Archivage et gestion de la collection de souches bactériennes produite (activités 2 et 3)
o Gestion des stocks de consommables, réactifs de laboratoire, commandes…
o Gestion et archivage des protocoles, fichiers de résultats, etc

Compétences

Savoirs / connaissances
-Connaissances fondamentales approfondies en microbiologie générale et environnementale
-Connaissance des règles d’hygiène et de sécurité liées à la manipulation des microorganismes, des produits toxiques, des produits contaminants
-Maîtrise minimum de l’anglais
Savoir-faire
-Cultures de microorganismes, travail en conditions stériles
-Très bonnes compétences d’organisation (du temps de travail, de l’utilisation des équipements, du matériel)
-Capacité à lire et analyser de la littérature scientifique pour aller chercher des informations utiles à la mise au point des protocoles et des expériences.
Savoirs-être
-Capacité à travailler en équipe, bonnes compétences en communication (sur le plan scientifique et interpersonnel)
-Rigueur, sens du détail, organisation, ponctualité

Contexte de travail

Le Laboratoire d'Océanographie MICrobienne (LOMIC) est une Unité Mixte de Recherche Sorbonne Université-CNRS (UMR 7621) rattachée à l'Institut National des Sciences de l'Univers (INSU) du CNRS. Le LOMIC rassemble des compétences dans les domaines de la biogéochimie marine, de l'écologie microbienne, de la biodiversité, de la physiologie, de l'écotoxicologie des microorganismes marins et de la modélisation mathématique. Cette pluridisciplinarité permet d'aborder de manière originale des questions aux frontières de la science.

L’objectif de nos travaux de recherche transdisciplinaire, du « gène aux écosystèmes », est d’apporter des bases fondamentales à la compréhension et à la prédiction des réponses des différentes composantes microbiennes marines (procaryotes et eucaryotes) aux changements anthropiques et climatiques. L’unité est structurée en trois axes thématiques de recherche : 1) Régulation des fonctions microbiennes par les paramètres environnementaux, 2) Biogéochimie et diversité microbienne, 3) Ecotoxicologie microbienne marine.

La personne recrutée travaillera en collaboration étroite avec la responsable du projet et avec la doctorante de l'équipe, et sera amenée à co-encadrer un.e voire plusieurs stagiaires (niveau M2).

Contraintes et risques

Pas de risques majeurs identifiés. Nécessité de s'adapter ponctuellement aux besoins expérimentaux (travail en soirée ou le weekend). La personne recrutée sera potentiellement amenée à participer à une mission océanographique.