Missions

Au cours de ce post-doctorat, un nouveau module de microscope sera développé afin de permettre l'imagerie sans marquage de sphéroïdes neuronaux en lévitation acoustique.
Le module combinera 3 modalités d'imagerie dont une nouvelle modalité inventée à l'Institut Langevin:
-L'OCT plein champ dynamique permet de révéler toutes les cellules d'un tissu ou d'une culture sans cellulaire sans marquage via l'analyse des fluctuations temporelles de signaux d'OCT plein champ
-Un OCT spectral permettant la visualisation du volume du sphéroïde
-de l'imagerie de fluorescence

Le/La post-doctorant(e) aura pour mission de développer le module, de le connecter à un micoscope commercial, et à développer un porte échantillon permet l'imagerie d'échantillons en lévitation acoustique. Il/Elle fera l'interface avec deux équipes de collaborateurs qui développent les cultures de cellules en lévitation pour intégrer leurs besoins dans le système d'imagerie

Activités

-Conception et réalisation d'un module d'imagerie
-Développement d'algorithmes de traitement de données automatisé
-Réalisation de puces de lévitation acoustique et intégration au microscope. Réalisation d'interfaces mécaniques et d'impression 3D pour faire l'interface
-Imagerie d'échantillons biologiques et discussion avec des physiciens et des biologistes pour optimiser l'imagerie
-Travail bibliographique et d'écriture d'articles scientifiques
-Présentation régulière des résultats
-Participation à la vie scientifique de l'équipe et collaboration avec les autres membres de l'équipe

Compétences

-Un doctorat en biophotonique, ou équivalent est attendu
-Le/la candidat(e) doit maitriser des concepts de microscopie basiques et avancés. Une expérience en imagerie sans marquage, voire par Tomographie à Cohérence Optique serait avantageuse
- Le/la candidat(e) doit être capable de présenter son travail à une audience interdisciplinaire de biologistes/physiciens et médecins. Un intérêt pour l'interdisciplinarité est nécessaire pour mener à bien ce projet
-Un niveau avancé en programmation (idéalement Matlab ou Python) est demandé
-Il est attendu que le/la candidat(e) maitrise les compétences nécessaires à la tenue d'un projet de recherche (recherche bibliographique/ écriture d'article/ présentation des résultats/organisation d'un projet)

Contexte de travail

Le travail correspond à la première partie d'une ANR collaborative qui vise à l'étude de sphéroïdes cérébraux sous lévitation acoustique et sous contraintes mécaniques induites pour étudier l'impact de la mécanique sur la croissance et le fonctionnement neuronale.
La première partie de ce projet implique le développement d'un nouveau microscope qui sera conçu et réalisé par le/la postdoctorant(e) à l'Institut Langevin, au 1 rue Jussieu à Paris. Le microscope sera ensuite déplacé dans le laboratoire du PMMH, également au 1 rue Jussieu, pour réaliser l'imagerie sur des sphéroïdes cellulaires. Les expériences biologiques, et notamment la lévitation acoustique sont maitrisés par les chercheurs du PMMH et seront enseignés au cours du postdoctorat.

L'institut Langevin est un laboratoire de l'ESPCI Paris spécialisé sur les ondes en milieux complexes. Le laboratoire a une longue expérience concernant la microscopie optique sans marquage, et notamment les techniques d'OCT et d'OCT plein champ dynamiques. Au cours d'une ANR précédente, un module d'OCT plein champ dynamique a déjà été réalisé et le but de ce post-doctorat est de reproduire ce module et d'y ajouter d'autres modalités d'imagerie plus classique. Le/la post-doctorant(e) bénéficiera donc de tout le savoir faire accumulé précédemment au laboratoire