Missions

Au sein du CEBC et du service commun "Biologging, Analyse et Modélisation des données", la personne sera chargée d'évaluer et de mettre en place la chaine d'analyse des données acoustiques récoltées dans le cadre du programme de suivi des chiroptères sur la forêt de Chizé (convention de coopération OFB – CNRS).

Activités

Sous la responsabilité du porteur de projet, l'IE sera principalement chargé(e) :
- d'évaluer la pertinence de différents systèmes existants de classification automatique des sons de chiroptères dans le cadre du programme,
- de mettre en place une procédure intégrant les outils de traitement des données (prétraitement, classification, validation, consolidation), de la donnée brute (fichier son) jusqu'à la production et la synthèse des résultats (présence ou indice d'activité des espèces par point d'échantillonnage),
- d'améliorer la constitution de la base de données des sons de référence du programme,
- de participer à la prise de données sur le terrain.

Compétences

- Connaissances de base dans le traitement du signal acoustique,
- Maîtrise des outils courants d'analyse des données acoustiques,
- Connaissances théoriques et maîtrise en programmation (principalement langage R, Python…) et biostatistiques (classifications…),
- Intérêt pour les outils de visualisation interactive (ex : Shiny),
- Maîtrise et/ou compréhension des systèmes de bases de données,
- Expérience dans l’utilisation du logiciel de version de contrôle Git,
- Des connaissances générales sur la biologie et l'écologie, notamment des chiroptères, seraient un atout,
- Aptitude à la gestion de projets,
- Maîtrise de l'anglais scientifique (oral, écrit),
- Travailler en interaction, rendre compte,
- Disposer d'excellentes qualités relationnelles
- Capacité à travailler en équipe et en autonomie.

Contexte de travail

L'IE recruté-e travaillera au Centre d'Etudes Biologiques de Chizé (UMR 7372 CNRS – La Rochelle Université) situé à Villiers-en-Bois (79), au sein du service commun "Biologging, Analyse et Modélisation des données". Le laboratoire CEBC est composé d'une quarantaine de permanents employées par le CNRS, l'INRAe et La Rochelle Université, ainsi qu'une trentaine de contractuels et étudiants. Ses thématiques de recherche sont liées à la compréhension des processus écologiques, pour comprendre comment les espèces et les écosystèmes sont impactés par les changements globaux induits par l’être humain.

Il / elle intégrera le programme de suivi à long terme des chiroptères du massif de Chizé dans le cadre de la coopération OFB-CNRS-ONF-LBBE "Interactions trophiques et dynamiques des communautés animales et végétales en forêt : une approche intégrative de l’écosystème forestier". Ce suivi à long terme est mis en place depuis 2016, et consiste en la pose d'enregistreurs automatiques à ultrasons sur 49 points d'écoute à l'intérieur et à l'extérieur de la Réserve Biologique Intégrale de la Sylve d'Argenson.