Missions

le poste proposé vise à caractériser structuralement par cryo-EM des complexes ARN:Protéine (snoRNP) cross-linkés. L’ingénieur aura également en charge la plateforme d’analyse cryo-EM du Service Mutualisé de Plateformes (SMP) du pôle Biologie-Médecine-Santé.

Activités

L’équipe recruteuse s’intéresse à l’étude fonctionnelle et structurale de la biogenèse de deux classes spécifiques de particules ribonucléoprotéiques (RNP), les snoRNP à boîtes C/D et H/ACA qui catalysent respectivement la 2’-O-méthylation des riboses et la conversion d’Uridine en pseudouridine au niveau des ARN ribosomiques et de transfert. Leurs défauts d'assemblage conduisent à des pathologies humaines sévères. Pour cette raison, il est essentiel de comprendre précisément comment ces particules sont produites .
Le projet scientifique du poste est dédié au développement de nouveaux réactifs chimiques de cross-links protéine-ARN basés sur le repositionnement de drogues déjà utilisées en thérapie. Le/la candidat(e) caractérisera structuralement des intermédiaires d’assemblages des snoRNP C/D et/ou H/ACA afin de valider biologiques les agents de cross-links proposés. Le projet sera réalisé en étroite collaboration avec les autres équipes du consortium ANR NAProt-XLMS.
Dans ce contexte et en tant qu’ingénieur (H/F) de recherche, vous aurez mission de :
- Réaliser la préparation des échantillons biologiques en vue de leur analyse par cryo-EM
- Réaliser l’acquisition des images sur le cryo-microscope 200 kV du SMP de l’Université de Lorraine et leur analyse en particule unique (SPA) pour des analyses structurales de haute précision.
- Développer et optimiser les protocoles d'acquisition de données et de traitement d'image pour répondre aux besoins des projets de recherche
- Participer à l'interprétation des résultats scientifiques et à la rédaction de publications.
- Assurer les prestations de la plateforme de cryo-EM
- Former et encadrer les utilisateurs internes (y compris les étudiants) sur les aspects techniques et scientifiques de la Cryo-EM.

Compétences

Le candidat (H/F) doit être titulaire d'un doctorat en biologie moléculaire, biochimie ou biologie structurale. Il/Elle doit avoir de très bonnes connaissances en biochimie des ARN et des protéines, biophysique des interactions et biologie structurale. Une expérience des techniques modernes de biologie moléculaire (manipulation d'ARN, culture cellulaire et transfection), de biochimie (co-expression, purification par IP, IMAC et filtration sur gel) sera demandé. Une solide expérience des techniques de cryo-EM (préparation d’échantillons cryogéniques, collecte des données et leur analyse) et une connaissance des logiciels de traitement d’images (RELION, CryoSPARC, …) sera indispensable. Des compétences en modélisation structurale seront appréciées. Le/la candidat(e) doit être très motivé, capable de travailler dans une équipe multidisciplinaire, montrer une bonne communication orale et écrite en français et en anglais, rigoureux, avec un esprit d’analyse et autonome.
Le candidat (H/F) doit envoyer une lettre de motivation décrivant son intérêt dans la recherche, un CV et les noms/e-mails d'au moins deux personnes référentes à xavier.manival@univ-lorraine.fr.

Contexte de travail

le laboratoire IMoPA est une unité mixte de recherche entre le CNRS et l'Université de Lorraine (UMR 7365, voir http://www.imopa.cnrs.fr/ et https://www.univ-lorraine.fr/) située à Vandœuvre-lès-Nancy. Il fait partie du pôle Biologie-Médecine-Santé (BMS, https://bms.univ-lorraine.fr). Le laboratoire est localisé sur le campus Biologie-Santé dans le bâtiment Biopôle. Le travail sera effectué dans le groupe de biologie structurale intégrative de X. Manival (http://www.researchgate.net/profile/Xavier_Manival). Le groupe fait partie de l'équipe « ARN/P » du laboratoire IMoPA au sein d'une équipe dynamique travaillant sur la relation structure/fonction des ARN et des RNP. La recherche globale de l'équipe vise à fournir des informations sur les processus d'assemblage des RNP non codantes dans les cellules, à étudier les facteurs impliqués et les conséquences dans les cellules d'un défaut de ces processus.
Nous offrons un environnement de travail conséquent avec des installations structurelles pour la biologie structurale intégrée comprenant notamment un spectromètre RMN (Bruker) à 600 MHz avec une cryosonde TCI (1H, 13C et 15N), des robots de criblage (Mosquito and TECAN), un diffractomètre à rayons X (X8-Proteum Bruker), un cryo-microscope électronique à transmission de 200 kV (ThermoFisher Scientific, Glacios v2) et des appareils classiques de biophysique (ITC, DLS, CD, SPR). L’ensemble des équipements sont à disposition de la communauté scientifique via la plateforme B2S (https://umsibslor.univ-lorraine.fr/fr/plateforme/biophysique-biologie-structurale-b2s).
Le poste d’Ingénieur(e) de Recherche est financé par l'ANR NaProt-XLMS, et fait partie d'un projet collaboratif avec 3 autres laboratoires de recherche.

Contraintes et risques

Le cryo-microscope Glacios 2 du SMP se trouve au sein de l’Institut Jean Lamour à 10 min en voiture du Biopôle. Une fois par semaine, il est nécessaire de faire le plein en azote liquide du cryo-microscope à l’aide d’un tank sur roulettes de 200 litres.