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Portail > Offres > Offre UMR7332-CATLEV-037 - CDD Jeune Chercheur (H/F)

CDD Jeune Chercheur (H/F)

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
- Français-- Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 19 avril 2024

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Informations générales

Intitulé de l'offre : CDD Jeune Chercheur (H/F)
Référence : UMR7332-CATLEV-037
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MARSEILLE 09
Date de publication : vendredi 29 mars 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 3 mois
Date d'embauche prévue : 1 mai 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2992.93 € bruts mensuels.
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Interactions, particules, noyaux du laboratoire au cosmos

Missions

Missions sur la segmentation et suivi des déformations de gouttes d’huile dans le ganglion lymphatique
Le but de ce projet est de caractériser les forces mécaniques à l’œuvre dans les ganglions lymphatiques lors de la reconnaissance d'antigène par des cellules immunitaires. Nos collaborateurs expérimentaux (Institut Cochin, Institut Pierre-Gilles de Gennes) utilisent des gouttelettes d'huile déformables pour étudier la rhéologie du ganglion lymphatique. La plupart des expériences seront réalisées dans des coupes d'organes, qui permettent de manipuler physiquement le système pour étudier l'effet des perturbations mécaniques à l'échelle du tissu sur la fonction immunologique des cellules B (formation de synapses et acquisition d'Ag). Cet objectif nécessite le développement et la mise en œuvre d'outils spécifiques pour suivre les déformations des gouttelettes dans des tranches de ganglions lymphatiques frais. La mission du CDD jeune chercheur (H/F) consiste à réaliser ce suivi des gouttelettes, tout en quantifiant la densité et les fluctuations des cellules immunitaires. Du point de vue de la physique, nous nous attendons à ce qu'une augmentation de la densité du tissu (induite par la compression, les médicaments ou l'inflammation) modifie la dynamique des gouttelettes.

Activités

Développement de nouveaux outils de segmentations (réentrainement du code Stardist) et de tracking (Trackmate) via des outils d’apprentissage profond. Segmentation cellulaire en 3D avec CellPose.
Conceptualisation : inférences de corrélations entre déformabilités des gouttes et de déplacement.

Compétences

Connaissances informatique (Programmation en Matlab, C++, Python) et théorique (Hydrodynamique des systèmes complexes, Physique Statistique, Méthodes d’inférences).

Contexte de travail

Travail de bureau situé au Centre de Physique Théorique.