Ingénieur d'étude (H/F) en Biologie cellulaire/Biologie Marine

Job Description

Missions

Un CDD de 8 mois d’Ingénieur d’étude expérimenté est ouvert à l’Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement de Nice (IRCAN, Université Côte D’Azur, Nice, France). Ce CDD est financé par la Fondation Gordon and Betty Moore dans la cadre du Symbiosis Model Systems Solicitation (grant #9322).
Le principal objectif des missions est de développer et/ou de valider différentes techniques de dissociation cellulaire pour permettre des analyses de ScRNAseq sur notre modèle d’étude, l’anémone de mer Anemonia viridis.
La symbiose Cnidaire-Dinoflagellés représente l'une des symbioses marines les plus importantes en milieu marin entre un métazoaire et un eucaryote unicellulaire (dinoflagellé de la famille des Symbiodiniaceae). Cette association est très répandue dans les écosystèmes côtiers tempérés et subtropicaux : elle est le fondement même de l'écosystème de récifs coralliens hautement productif et diversifié. À l'intérieur du cytoplasme de certaines cellules gastrodermales de l’hôte, le symbiote déclenche une communication complexe avec les cellules animales hôtes, entraînant de profonds changements physiologiques. Bien que cette symbiose marine soit étudiée depuis plusieurs décennies, la signalisation moléculaire entre les deux partenaires et les propriétés de compétence de symbiose de la cellule animale restent irrésolues en raison de l'absence d'un modèle fiable pour les approches cellulaires et fonctionnelles. L’ambition de ce projet est donc grâce à la technique du ScRNAseq d’identifier au sein du tissu de l’hôte animal les cellules compétentes pour la symbiose. Cette identification devrait permettre à terme, grâce à l’expertise acquise au sein de notre groupe de recherche dans le développement de cultures cellulaires de Cnidaire, l’établissement de cultures cellulaires spécifiques de la symbiose.
Dans le cadre de cette mission l’ingénieur.e travaillera sous la supervision directe du Pr. Furla et du Dr Barnay-Verdier. Le ScRNAseq sera réalisé en collaboration avec l’IPMC (UMR CNRS 7275) au sein de la plateforme UCAGenomix.

Activity

Les principaux défis, que devra relever l’IE recruté, reposent sur la mise en place et l’adaptation de techniques de dissociation cellulaire (type ACME) pour l’analyse en ScRNASeq. Ainsi il faudra pouvoir déterminer les conditions optimales et la faisabilité du transfert de protocoles existants sur notre modèle biologique. En parallèle, l’Ingénieur recruté devra également mener des expériences d’immunomarquages sur tissus et cellules.
Descriptif des missions :
- Culture et maintien de cultures cellulaires primaires issues d’A. viridis
- Développement de protocole de dissociation cellulaire
- Extraction ADN-ARN et analyses moléculaires (PCR, RT-qPCR)
- Immunomarquages
Une partie de la mission nécessitera une analyse bio-informatique des données de ScRNAseq.

Your Profil

Skills

La candidate/le candidat sélectionné devra maîtriser de solides connaissances sur la biologie des organismes marins. Une expérience acquise dans la culture cellulaire d’invertébrés marins ainsi que dans la mise en place de protocole de dissociation cellulaire sur ces organismes est fortement recommandée. La capacité à analyser les jeux de données issus du ScRNAseq serait un plus.

Your Work Environment

Notre groupe de recherche « Symbiose Marine » (IRCAN, Nice) utilise comme modèle d’étude des organismes marins, les Cnidaires symbiotiques. Une de nos thématiques principales est donc de comprendre les bases cellulaires, moléculaires de l’établissement de la symbiose Cnidaire-Dinoflagellés grâce à un modèle d’étude, l’holobionte Anemonia viridis (une anémone de mer tempérée), pour lequel nous avons développé des cultures cellulaires des deux partenaires de la symbiose (animal et symbiotes). Pour accomplir au mieux sa mission l’IE recruté bénéficiera de l’ensemble des appareillages scientifiques nécessaires.

Constraints and risks

RAS

Compensation and benefits

Compensation

salaire brut mensuel compris entre entre 2521€ et 3743€ selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

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