Missions

Le post-doctorant contribuera à l'étude des communautés microbiennes de Saccharomyces. Cela comprend l'analyse génomique des populations, la reconstruction des communautés microbiennes et l'étude de leurs interactions. Le post-doctorant collaborera également à d'autres projets en cours dans le groupe (https://ircan.org/en/research/gianni-liti).

Activités

Le post-doctorant effectuera des expériences et des analyses informatiques pour caractériser les communautés microbiennes de Saccharomyces :

Principales tâches :
- Séquençage du métagénome et analyse bioinformatique
- Isolement et caractérisation des espèces microbiennes
- Étude des interactions microbiennes par phénotypage et transcriptomique
- Étude des flux de gènes entre les communautés microbiennes par génomique et phénotypage

Compétences

Une expérience préalable en génétique et génomique de la levure est essentielle.
Une connaissance avancée de l'analyse bioinformatique par séquençage de nouvelle génération est essentielle, de même qu'un solide bagage statistique.
Des compétences expérimentales et informatiques en métagénomique sont souhaitées.

Contexte de travail

Le post-doctorant sera affecté à l'équipe du Dr Gianni LITI « Génomique des populations et caractères complexes ». L'équipe est l'une des équipes fondatrices de l'IRCAN et est située à la Faculté de Médecine de Nice. L'équipe dispose de tout l'équipement nécessaire pour les expériences de génétique et de génomique de la levure et a accès à des équipements de pointe en microscopie, cytométrie et génomique, ainsi qu'à des serveurs de calcul et de stockage.

Contraintes et risques

Le système avec lequel nous travaillons (la levure) est connu pour être sûr et non pathogène. Certains des produits chimiques utilisés dans les expériences sont toxiques et doivent être manipulés conformément aux instructions. Une initiation à la sécurité sera dispensée avant le début des activités expérimentales.