Missions

Les photo-endosymbioses sont présentes partout dans l’environnement et elles ont évolué à de multiples reprises en ce qui concerne les endosymbioses secondaires. Pourtant les conditions environnementales et les changements biologiques qui ont permis le maintien à long terme de ces associations restent peu compris. Ce projet consiste à étudier les causes possibles de l’apparition et la maintenance des photo-endosymbioses primaires et secondaires. Pour cela, une approche d’évolution expérimentale dans des environnements contrôlés est mise en place. Plusieurs organismes modèles sont utilisés : l’eucaryote cilié Tetrahymena thermophila comme hôte et des organismes photosynthétiques unicellulaires procaryotes (Synechococcus elongatus) ou eucaryotes (Chlorella variabilis) comme modèles de symbiontes.

Activités

- Cultures de microorganismes unicellulaires eucaryotes et procaryotes en conditions stériles (principale)
- Microscopie (contraste de phase et fluorescence) (principale)
- Analyse transcriptomique différentielle (préparation des ARN et analyse des données) (principale)
- Analyse de données quantitatives et statistiques avec le logiciel R (secondaire)
- Gestion des conditions d’anaérobiose / microaérophilie (secondaire)
- Cytométrie en flux (secondaire)
- Encadrement d’étudiants et stagiaires (principale)
- Présentation des résultats à la communauté scientifique (poster et congrès en anglais) (principale)
- Valorisation des travaux sous forme de publication scientifique (principale)

Compétences

- Formation et connaissances en évolution et sciences de l’environnement.
- Compétences en microbiologie (cultures axéniques et cultures en conditions d’anoxie)
- Compétences en microscopie et/ou cytometrie de flux non obligatoires, pouvant être acquises sur place.
- Préparation des ARN et analyse des données transcriptomiques différentielles (pouvant être acquises pendant la durée du poste).
- Analyse des données quantitatives et statistiques avec R
- Anglais lu et parlé
- Capacité de communication et d’interaction avec les autres membres de l’équipe / laboratoire
- Présentation des résultats scientifiques (poster et congrès en anglais), synthèse bibliographique et participation à l’écriture de publications.

Contexte de travail

Le chercheur/ la chercheuse travaillera au sein du LCB UMR7283 composé de 100 agents répartis en 15 équipes. Ce poste correspond à la prolongation et la fin de l’ANR PHOCEE prévue pour 2026. Le projet est à l'interface de 2 équipes, l’équipe Instrumentation Appliquée à la Microbiologie du Laboratoire de Chimie Bactérienne et le Laboratoire de Génétique et Biophysique des Plantes à la Faculté des Sciences de Luminy. Les expériences principales se feront sur le campus CNRS de J. Aiguier à Marseille.