Missions

Développement d'analyse d'image "single molecule Fluorescence In Situ Hybridization". Analyser et mettre en forme les résultats dans le cadre des projets de recherche de l’équipe.

Activités

o Développer des analyse d'image "single molecule Fluorescence In Situ Hybridization".
o Réaliser des expériences de biologie cellulaire, moléculaire et biochimie
o Assurer une veille scientifique et technique
o Analyse et traitement de données biologiques
o Rédiger les résultats sous forme d'article et les présenter à mes référents
o Encadrement de stagiaires : accompagnement dans la mise en œuvre des protocoles, transmission des bonnes pratiques en laboratoire, suivi des résultats expérimentaux

Compétences

 Savoirs / connaissances
o Développement de pipeline d'analyse d'image (R, Python, Fiji)
o Principes de la microscopie épifluorescence et confocale et analyse d'image
o Connaissances de base en analyse transcriptomique (RNA-seq)
o Réglementation en matière d’hygiène et de sécurité en laboratoire
o Connaissance des bonnes pratiques de laboratoire (BPL)
 Savoir-faire
o Entretien de souches C. elegans
o Imagerie cellulaire : immunomarquage, hybridation in situ (FISH), maîtrise des systèmes de microscopie confocale, à épifluorescence et scanner de lames
o Analyse d’image : développement de code
o Transcriptomique : analyse de données RNA-seq avec Galaxy
o Rédaction et optimisation de protocoles techniques
o Tenue du cahier de laboratoire
o Informatique : pack Office, R Studio, logiciels spécialisés de microscopie
 Savoirs-être
o Présentation orale de résultats lors de réunions d’équipe
o Communication en anglais scientifique
o Sens relationnel et travail d’équipe
o Capacité de raisonnement analytique
o Accompagnement des nouveaux membres sur les techniques acquises
o Capacité à travailler en autonomie sur les équipements et projets techniques
o Sens de l’organisation et respect des délais expérimentaux

Contexte de travail

Intégration dans l'équipe Epitranscriptomique de l'Insitut de Biologie Valrose
Conditions de travail (horaires, quotité de travail, astreintes, sujétions particulières, déplacements, équipements de protections exigées, sites, habilitation / autorisations indispensables, …) : 100 %, horaires variables selon les expériences, port des EPI adaptés selon l’expérimentation.
Contexte d’exercice du poste (spécificités de la structure/laboratoire ayant un impact sur l’exercice du poste ou sur plusieurs sites) : Bâtiment Sciences Naturelles et occasionnelement Bâtiment Biochimie
Moyens mis à disposition (appareillage, informatique…) : Paillasse de laboratoire, Cahier de laboratoire, PC portable.

Contraintes et risques

Manipulation d'échantillons biologiques