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Portail > Offres > Offre UMR7277-ARNHUB-005 - Post-doctorat en biologie cellulaire, H/F

Post-doctorat en biologie cellulaire, H/F

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Français - Anglais

Date Limite Candidature : lundi 13 février 2023

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Informations générales

Référence : UMR7277-ARNHUB-005
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : NICE
Date de publication : lundi 23 janvier 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 mars 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : between 2833.40 € and 3257.06 € dependinng brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années

Missions

Mise en œuvre du projet de recherche « Remodelage des condensats d'ARN au cours de la croissance des ovocytes » de l'équipe Epitranscriptomique de l'Institut de Biologie Valrose.

Activités

Le chercheur coordonnera le projet de recherche suivant: "Spatiotemporal control of maternal mRNAs in early development is critical for cell identity specification. Decades of research have focused on characterizing maternal mRNAs and their consequent protein products in oogenesis and embryogenesis, with less experimental attention dedicated to the biophysics of supramolecular assemblies that mRNAs are packaged into and their dynamic remodelling. Our findings strikingly uncovered that C. elegans maternal mRNAs are stored in ribonucleoprotein condensates that are dynamically remodelled throughout oogenesis. While some mRNAs are sequentially released from condensates to be translated, others are stored and protected for later embryonic development. Here, we propose (1) to systematically identify the remodelled interactions controlling RNA condensate compositional changes during oocyte growth, (2) to dissect how microtubules and RNA polymers regulate condensate supramolecular assembly, dynamics, and material properties, and (3) test how condensate phase separations protect mRNAs from decay. The researcher will utilize our recently developed Fluorescent Activated Particle Sorting method to characterize the transcriptome and proteome of RNA condensates at distinct oocyte growth stages. Structural nodes, multivalent interactions, RNA repeats, and regulators such as microtubules will be manipulated to test their impact on mRNA stability, condensate assembly, remodelling, and physical properties (i.e. viscoelasticity, cluster size, partition coefficient, saturation concentrations). This work would represent the first comprehensive assessment of RNA condensate compositional dynamics and their impact on RNA expression and stability in a cell specification model. Together, these studies will bring paradigm-shifts in our understanding of gene expression control, and reveal the emerging functions of a higher-scale of transcriptome organization that is conserved throughout evolution, from nematodes to mammals."

Compétences

-Expertise de Biologie cellulaire, Biologie moléculaire, Biochimie, Biologie du développement,
- Développement de code bio-informatique pour l'analyse d'image
-Autonomie dans la planification, la réalisation et l'analyse des expériences
-Rédaction d'articles scientifiques
-communication orales (réunion d'équipe, meeting internationaux…)
-Esprit d'équipe
-Formation des étudiants
-Connaissance des règles d'hygiène et de sécurité
-Respect de l'éthique scientifique

Contexte de travail

Le travail s'effectuera dans l'équipe épitrancriptomique, sous la supervision d'Arnaud Hubstenberger :
http://ibv.unice.fr/research-team/hubstenberger/

Contraintes et risques

-Connaissance des règles d'hygiène et de sécurité d'un laboratoire
-Manipulation d'animaux modèles de laboratoires : C. elegans
-Risques biochimiques, notamment manipulations de produit chimiques toxiques incluants mais non restreint : Formaldehyde, Tryzol, Phenol, Chloroforme, Azide de Sodium, Methanol, Formamide

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