Missions

Le laboratoire d'épigénétique et métabolisme est à la recherche d'un bioinformaticien de haut niveau pour contribuer au consortium Gametic Epigenetic Consortium against Obesity (GECKO).
Le GECKO vise à identifier les mécanismes par lesquels le stress nutritionnel avant la conception influence le phénotype de la progéniture de la prochaine génération. En particulier, le consortium utilise une approche épigénomique comparative dans les spermatozoïdes qui vise à identifier le profil épigénétique établi par le stress alimentaire et qui est conservé tout au long de l'évolution.
Pour répondre à cette question de recherche, nous recherchons un bioinformaticien au niveau postdoctoral avec une expérience préalable en génomique comparée..

Activités

Les principales tâches du candidat retenu seront :
1- Analyser les données de séquençage de nouvelle génération (RRBS, WGBS, small RNASeq, ATAC-Seq)
2- Comparer les signaux épigénétiques de différentes espèces
3- Communiquer les résultats lors de réunions régulières au sein du consortium GECKO et à l'extérieur
4- Préparer des publications incluant des illustrations et figures

Compétences

Critères essentiels :
- Un doctorat en bioinformatique ou en biologie computationnelle ou dans un domaine étroitement lié ;
- Expérience documentée dans la réalisation d'analyses informatiques de génomique comparative ;
- Maîtrise de plusieurs langages de programmation, tels que python, R et shell ;
- Solide formation en mathématiques pour les analyses statistiques et le machine learning;
- Capacité à travailler en équipes multidisciplinaires;
- Excellentes compétences en communication orale et écrite en anglais;
- Excellentes compétences en organisation et gestion de projet.

Critères souhaitables:
- Expérience dans la conduite d'expériences en laboratoire liées à la biologie moléculaire, à la génomique et à l'épigénomique
- Expérience dans la présentation de résultats de recherche dans des conférences internationales ;
- Connaissances de base dans le domaine de l'hérédité épigénétique.

Contexte de travail

Le candidat retenu sera membre du Laboratoire Epigénétique et Métabolisme dirigé par le Pr Romain Barrès à l'Institut de Pharmacologie Cellulaire et Moléculaire (IPMC), un CNRS/Université Côte d'Azur. Elle/Il rendra compte au Pr Barrès et au Directeur de l'IPMC Dr. Florian Lesage.

Informations complémentaires

Pour candidater, envoyer une lettre de motivation qui élabore sur CHACUN des points essentiels ainsi qu'un curriculum vitae incluant la liste de toutes les publications de recherche.