Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche dans le domaine du codage/décodage pour le stockage de données numériques dans l'ADN synthétique (H/F)
Référence : UMR7271-VIVROS-042
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : SOPHIA ANTIPOLIS
Date de publication : vendredi 3 mars 2023
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2609.40.40 et 3257.06 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Supérieur à bac+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Informatique, Statistiques et Calcul scientifique
Emploi type : Expert-e en calcul scientifique
Missions
Le stockage des données numériques devient un défi pour l'humanité en raison de la durée de vie relativement courte des dispositifs de stockage. En outre, l'augmentation exponentielle de la génération de données numériques crée le besoin de construire constamment de nouvelles ressources pour gérer le stockage de ce volume de données. Des études récentes suggèrent l'utilisation de la molécule d'ADN comme un nouveau candidat prometteur qui peut contenir 500 Goctet/mm^3 (1000 fois plus que les disques durs). Toute information numérique peut être synthétisée en ADN in vitro et stockée dans de minuscules capsules de stockage spéciales qui peuvent permettre une fiabilité pendant des centaines d'années. La séquence d'ADN stockée peut être récupérée à tout moment à l'aide de machines spéciales appelées "séquenceurs". L'ensemble de ce processus est très difficile car la synthèse de l'ADN est coûteuse et le séquençage est sujet à des erreurs.
Notre équipe a étudié le codage efficace des informations numériques dans l'ADN synthétique au cours des 6 dernières années et a développé une solution de codage pour le codage efficace des données numériques dans un code quaternaire qui se compose des 4 bases de l'ADN A (Adénine), T (Thymine), C (Cytosine) et G (Guanine) selon les besoins du stockage des données sur de l'ADN.
Activités
L'objectif principal de ce contrat d'un an est de transférer le code qui a déjà été développé dans MATLAB au cours de nos études, vers un langage de programmation plus largement utilisé dans l'industrie tel que C++ ou python, tout en ajoutant quelques fonctionnalités supplémentaires et en optimisant la complexité du code.
Compétences
• Hautement motivé et bon esprit d'équipe.
• Doctorat en traitement du signal ou des images ou dans une discipline connexe.
• Compétences expérimentées en développement, C/C++ ou équivalent, Matlab,
Python.
• Capacité à travailler avec des logiciels tiers et à établir des contacts constructifs
avec les développeurs de ces logiciels.
• Une connaissance du codage d'images, de l'apprentissage automatique au sens
large et de la biologie synthétique sera appréciée.
• Une expérience dans le domaine de la synthèse et du séquençage de l'ADN
sera appréciée.
• La curiosité, l'ouverture d'esprit, la créativité, la persistance, le
professionnalisme, la responsabilité et l'esprit d'équipe sont les principales
compétences personnelles que nous recherchons pour ce poste.
Contexte de travail
Le titulaire du poste travaillera au laboratoire I3S dans le groupe de recherche SIS/MediaCoding et aura l'occasion de travailler sur un sujet émergent en collaboration avec d'autres membres de l'équipe. Ce travail rentre dans le cadre d'un transfert technologique du laboratoire I3S vers l'industrie.
Contraintes et risques
aucune