Ingénieur de Recherche en Écologie Moléculaire et Analyse de Données ADNe (H/F)

Job Description

Missions

La personne exercera son activité au CNRS, à l'IRBI, dans le cadre du projet DYNABIOD qui ambitionne de comprendre comment plantes et invertébrés sont affectés par les activités humaines et les changements environnementaux, afin d’agir plus vite et de manière plus juste pour la conservation des espèces et la préservation des bénéfices de leurs rôles écosystémiques. Les objectifs spécifiques de ce poste sont d’évaluer la faisabilité et les limites de l’ADN environnemental digestif pour reconstruire les réseaux d’interactions trophiques. Le travail se concentrera sur la description du régime alimentaire des carabes. Une part important du travail sera également consacrée à la conception et la mise à l’épreuve d’amorces PCR bloquantes spécifiques aux Carabidae, afin d’optimiser la détection des séquences de proies. Ce travail s’inscrit à la suite d’une thèse dédiée à l’impact des changements de pratiques agricoles (30 dernières années) sur les régimes alimentaires des carabes et les communautés d’invertébrés du sol.

Présentation de l’équipe : La/le chercheur.se intégrera l’équipe IMIP : Interactions Microorganismes Insectes Plantes de l’IRBI, travaillera en collaboration avec les participants académiques du projet DYNABIOD et pourra participer à l’encadrement d’étudiants.

Activity

La personne recrutée sur ce poste aura comme tâche d’organiser la collecte et le stockage d’échantillons en provenance des collections du Centre Biologique de Chizé et potentiellement d’autres sources. De réaliser les analyses moléculaires en amont du séquençage NGS. Les tâches incluront donc la dissection des insectes en conditions stériles, l'extraction d'ADN à partir du contenu des tubes digestifs, l'amplification par PCR de l'ADN des proies et la préparation des librairies NGS pour le séquençage sur plateforme illumina.
La personne recrutée travaillera également à l'analyse statistique des données qui seront produites par les bio-informaticiens du projet DYNABIOD. De nouveau échantillons seront également collectés sur le terrain au printemps et été 2027. Des déplacements sur les sites de collecte seront donc organisées, notamment dans la Zone Atelier Plaine et Val de Sèvres, mais aussi dans des parcelles agricoles en Région Centre. Il est attendu de cette personne qu’elle soit moteur dans la production d’articles scientifiques et la diffusion des résultats. Elle participera aussi activement à la vie de l’équipe IMIP aussi bien sur le plan scientifique qu’organisationnel.

Your Profil

Skills

Le·a candidat·e sera titulaire d’un doctorat en biologie, doté·e de solides compétences en entomologie, notamment en taxonomie et dissection d’insectes, ainsi qu’en biologie moléculaire, avec une expertise avérée en métabarcoding ADN (incluant l'extraction d’ADN environnemental, l'amplification pas PCR, la préparation de librairies NGS). La maîtrise des statistiques descriptives et multivariées sous R est également requise afin d'analyser les données produites.
Une expérience de terrain en entomologie sera particulièrement appréciée. Enfin, le·a candidat·e devra être titulaire du permis B et justifier d’un niveau d’anglais C1 pour évoluer dans un environnement scientifique international.

Your Work Environment

L’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) se consacre à l’analyse des interactions entre les insectes et leur environnement biotique et abiotique. L’IRBI est doté d’une force vive et dynamique de 27 chercheurs/enseignants-chercheurs permanents. L'institut s'appuie également sur les compétences de nombreux post doctorants et chercheurs contractuels ainsi que 18 doctorants pour un effectif global de 75 personnes. L’IRBI organise de façon régulière des séminaires scientifiques sur de thèmes variés liés aux insectes.

Compensation and benefits

Compensation

3143,64 et 3403,43 euros brut mensuel selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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