Assistant Ingenieur (H/F)

Job Description

Missions

La mission principale de l'assistant ingénieur (H/F) se fera dans le cadre du Projet de Recherche Translationnelle en Cancérologie portant sur les cancers du sein ER+/ HER2– avec mutation BRCA ou altération de la recombinaison homologue et présentant une double dépendance à la signalisation hormonale et à la réparation de l'ADN. L'assistant ingénieur (H/F) sera détaché sur la plateforme d'histopathologie expérimentale de l'IPC/CRCM (ICEP). Il / elle aura pour mission de caractériser, par imagerie multiplex MACSima, les profils protéiques spatiaux des altérations de la réponse aux dommages de l'ADN et immuno- oncologiques au sein de cohortes de bons et mauvais répondeurs de l'essai DOLAF qui a montré une hétérogénéité marquée de réponses aux traitements.

Activity

• Mise au point des marqueurs de la réponse aux dommages de l'ADN (DDR) par immunohistochimie/immunofluorescence dans les conditions expérimentales du MACSima Miltenyi.
• Transfert des protocoles au MACSima Miltenyi.
• Conception des panels associant des cibles immuno-oncologie validées et les protéines DDR.
• Preprocessing des données brutes issues du MACSima et contrôle qualité.
L'assistant ingénieur-e aura :
• Une forte expertise technique en IHC et IHC multiplex dans le visible et/ou en fluorescence : mises au point et conduite de projets/protocoles
• La connaissance technique des outils de microscopie, des scanners de lames et des automates d'IHC
• La maitrise des techniques classiques utilisées en histologie : connaissance de l'échantillon en FFPE, coupes, colorations, Immunohistochimies, TMA..
• La connaissance du logiciel MACSiQ serait un plus
• Une expertise en transcriptomique spatiale serait un plus (technologies Visium et Xenium 10X Genomics)

L'assistant ingénieur (H/F) contribuera à la valorisation scientifique des données :
• Participer à la rédaction de protocoles et de rapports d'activité
• Contribuer à la préparation de publications scientifiques et communications
• Présenter les avancées techniques en réunion de plateforme et d'équipe
• Gérer les stocks des consommables nécessaires aux expérimentations
• Assurer la maintenance des équipements dédiés
• Participer aux actions de structuration et amélioration continue de la plateforme ICEP
• Participer à la formation des utilisateurs de la plateforme ICEP

Your Profil

Skills

Savoir faire :
Savoir organiser et planifier ses expérimentations en prenant en compte l’activité d’ensemble de la plateforme
Pouvoir coordonner la réalisation technique de plusieurs projets
Utiliser des outils informatiques adaptés au traitement des données
Savoir structurer et rédiger une documentation technique ou une procédure technique
Maîtriser l'anglais scientifique et technique à l’oral et à l’écrit




Savoir être :
Autonomie, esprit d’initiative et capacité d'adaptation
Rigueur méthodologique et sens de l'organisation
Esprit d'équipe et bonne communication
Feed back
Capacité à apprendre de nouvelles approches analytiques
Respect de la confidentialité

Your Work Environment

Cet agent travaillera au sein de la plateforme de service d'histopathologie expérimentale ICEP, labélisée plateforme AMU et IBiSA et codirigée par deux responsables scientifiques, Pr Emmanuelle Charafe et Dr Michel Aurrand-Lions ainsi qu'une responsable opérationnelle, Anne Farina.
Située à l'interface entre l'Institut Paoli-Calmettes (IPC) et le Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), ICEP a pour vocation d'offrir une aide et une expertise à la réalisation du versant histologique des projets de recherche clinique, translationnelle et fondamentale du site. Actuellement, cette plateforme évolue vers des solutions de multiplexage en immunohistochimie, de l'analyse d'image, et des technologies spatial-multiomiques. C'est dans ce cadre que l'assistant ingénieur (H/F) recruté effectuera ses missions, au service de l'équipe Telomères et Chromatine codirigée par Dr Alexandre de Nonneville et Dr Stéphane Coulon.

Compensation and benefits

Compensation

Entre 2347.95 € et 3424.60 € brut mensuel selon l'expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

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