Missions

Un poste de chercheur post-doctorant (H/F) est ouvert à l’Institut Fresnel (UMR 7249 CNRS / Aix-Marseille Université / École Centrale Marseille) pour étudier les mécanismes biophysiques à l’origine de la morphogénèse des cryptes intestinales.
Le ou la candidate participera à l’exploration des interactions mécaniques entre l’épithélium intestinal et la matrice extracellulaire (ECM) lors de la morphogenèse de la crypte, en combinant des approches expérimentales avancées de microscopie quantitative, mécanique tissulaire et en lien avec la modélisation physique.
 Le projet vise à comprendre comment les forces générées par les cellules et les propriétés visco-élastiques de l’ECM coopèrent pour façonner es cryptes intestinales.
 Le ou la candidate bénéficiera d’un environnement exceptionnel réunissant biologistes et physiciens au sein d’un consortium regroupant l’Institut Fresnel (Loïc Le Goff) et l’Institut de Biologie du développement de Marseille (Delphine Delacour) ainsi que l'université de Genève pour la modélisation physique (Guillaume Salbreux). Il ou elle bénéficiera d’un accès privilégié à des technologies d’imagerie et de manipulation optique de pointe : microscopie super-résolue en 3D, imagerie adaptative à faible dose lumineuse, pinces optiques et ablation laser ciblée.

Activités

- Concevoir et mettre en œuvre des expériences de biophysique sur organoïdes intestinaux, pour caractériser la mécanique de la fission de crypte.
- Participer à la conception de dispositifs de culture sous microscope adaptés à l’imagerie longue durée et à la manipulation mécanique.
- Utiliser et développer des approches de microscopie à fluorescence et sans marquage (2 photon, SHG, SRS) pour suivre en direct la morphogenèse tissulaire.
- Mettre en œuvre des mesures mécaniques locales (pinces optiques, micro-rhéologie, ablation laser).
- Collaborer avec les équipes de biologie pour relier observations mécaniques et phénomènes cellulaires.
- Analyser quantitativement les données (segmentation 3D, champ de déformation, cartographie de tension).
- Participer à la valorisation scientifique : rédaction d’articles, présentations dans des congrès, encadrement ponctuel d’étudiants.

Compétences

- Formation en biophysique, physique des tissus vivants, bio-ingénierie ou discipline équivalente.
- Bonne maîtrise de la microscopie de fluorescence et des techniques de traitement d’image (FIJI, Matlab, Python).
- Connaissances souhaitées en mécanobiologie, optique expérimentale ou micro-rhéologie.
- Intérêt marqué pour la morphogenèse des tissus et le travail interdisciplinaire.
Capacité à travailler en équipe et à dialoguer avec des biologistes et des physiciens.
- Bon niveau d’anglais écrit et oral.

Contexte de travail

L’Institut Fresnel (UMR 7249 CNRS / Aix-Marseille Université / École Centrale Marseille) héberge le poste, au sein de l’équipe MOSAIC. La personne recrutée travaillera en étroite collaboration avec l’équipe de Delphine Delacour à l’IBDM, bénéficiant ainsi d’un environnement pluridisciplinaire alliant optique, physique et biologie du développement.
Le projet offre une occasion unique de contribuer à un programme ambitieux sur la mécanique de la morphogenèse épithéliale, à l’aide d’outils expérimentaux et théoriques de pointe.


Publications récentes de L. LeGoff
-Mangeat, Mazzella, …, LeGoff*, Sentenac* (2025). Super-resolved live imaging of thick biological samples with 3D RandomIlluminationMicroscopy (3D-RIM). BioRxiv. DOI: 10.1101/2025.08.06.668879
-Debadarshini, LeGoff*, Mavrakis* (2025). Septins in animal tissue architecture: more than just peanuts. Current Opinion in Cell Biology. 10.1016/j.ceb.2025.102525
-Martins, Iv, Suman, Panagiotou, Sidor, Ruso-Lopez, Plancke, Omi, Gomes, Llewellyn, Bandi, Laurie Ramond, Arbizzani, Rimoli, Schnorrer, Robin, Wilde, LeGoff, Pedelacq, Cabantous, Rincon, Chandre, Brasselet, Mavrakis (2025) Genetically encoded reporters of actin filament organization in living cells and tissues. Cell. 10.1016/j.cell.2025.03.003
-Mazzella, Mangeat, Giroussens, Rogez, Li, Creff, Saadaoui, Martins, Labouesse, Idier, Galland, Allain, Sentenac, LeGoff (2024). Extended-depth of field random illumination microscopy, EDF-RIM, provides super-resolved projective imaging. DOI: 10.1101/2023.10.30.564754. Sous presse à Light, science and applications
-Rigato, Meng, Chardes, Runion, Abouakil, Smith, LeGoff (2024). A mechanical transition from tension to buckling underlies the jigsaw puzzle shape morphogenesis of histoblasts in the Drosophila epidermis. PLos Biol, https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3002662

Publications récentes de D. Delacour
-Barai, Soleilhac, Xi, Lin, Karnat, Bazellières, Richelme, Lecouffe, Chardès, Berrebi, Rümmele, Thery, Rupprecht, Delacour (2025) Multicellular actin star network underpins epithelial organization and connectivity. Nature Comm.. 10.1038/s41467-025-61438-1
-Barai, A. & Delacour, D. (2025). High-Resolution Imaging of Spindle Orientation Dynamics in 3D Intestinal Organoids. Methods Mol Biol 2872, 257-267 doi.org/10.1007/978-1-0716-4224-5_18
-Saleh, et al. …, Delacour. (2023) Length limitation of astral microtubules orients cell divisions in murine intestinal crypts. Dev Cell 58, 1519-1533 e1516. doi.org/10.1016/j.devcel.2023.06.004

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Le poste est à pourvoir pour une durée initiale de 12 mois, renouvelable jusqu’à 36 mois. Il s’inscrit dans un environnement soumis à la réglementation PPST ; l’arrivée nécessitera une autorisation préalable du MESR.