Ingénieur d'études en Protéomiques et Bio-Informatique (H/F)

Job Description

Missions

Le candidat (H/F) aura pour missions principales, sous la responsabilité du responsable scientifique, de développer et conduire les méthodes utiles à l’acquisition des résultats dans le cadre de l’ANR DESIR. Le candidat/La candidate devra réaliser la préparation et l’analyse protéomique d’échantillons biologiques (matrices biologiques d’abeilles domestique), développer un pipeline d’intégration multimodale robuste, capable de fusionner des données génomiques/transcriptomiques/peptidomiques/protéomiques. Une telle approche vise à identifier des signatures biologiques et des motifs intégratifs reliant les différentes couches omiques à partir de différentes matrices biologiques d’abeilles, ceci dans le cadre du projet de recherche ANR-DESIR. Les données seront acquises par les différents partenaires de ce projet. Le candidat (H/F) aura notamment pour responsabilité l’analyse ainsi que la rédaction et la présentation des résultats qui seront générés.

Activity

• Réaliser la préparation et l’analyse protéomique de matrices biologiques d’abeilles domestiques (sang et corps gras)
• Développer un pipeline d’intégration multimodale robuste, capable de fusionner des données génomiques/transcriptomiques/peptidomiques/protéomiques acquises par les différents partenaires de ce projet
• Rendre compte de ses résultats aux différents partenaires du projet ANR-DESIR et assister aux différentes réunions en présentiel ou en distentiel
• Rédiger un cahier de laboratoire suivant les règles du LSMBO
• Préparer en langue anglaise les données, résultats et études bibliographiques nécessaires à toute communication scientifique (orale, affiche ou publication)

Your Profil

Skills

• De formation scientifique en biologie, biochimie et bio-informatique le candidat (H/F) devra posséder de solides connaissances en biochimie des protéines. Très bonnes connaissances pratiques et théoriques en analyses protéomiques par spectrométrie de masse multimodale
• Maîtrise de la préparation d'extraits protéiques à partir de matrices biologiques diverses issues d’abeilles domestiques (sang/hémolymphe et corps gras)
• Maîtrise des méthodes et outils d'analyse protéomique quantitative utilisant la spectrométrie de masse.
• Maîtrise de l'anglais écrit et parlé afin de rédiger des rapports sur les résultats et de les présenter lors de conférences scientifiques
• Des connaissances des contraintes liées au travail dans un environnement certifié ISO9001 seraient un asset
• Outils informatiques (traitement de texte, tableur)
• Langue anglaise : B1 à B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues
• Faire preuve de rigueur, d’un sens critique, d’organisation et rendre compte de ses résultats.

Your Work Environment

L’Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l’Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l’instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 4 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.
Le/La candidat(e) sera sous la responsabilité des responsables scientifiques du projet ANR-DESIR (partenaire DR10). Il/Elle rejoindra l'équipe LSMBO de l'IPHC, une équipe spécialisée dans le développement de méthodes d'analyse des biomolécules par spectrométrie de masse et stratégies bioinformatiques associées. Le LSMBO est équipé d’une gamme d’instruments permettant de réaliser des analyses protéomiques et l’interprétation bio-informatique des données acquises. Ces ressources instrumentales et informatiques permettent de répondre à des projets de recherche en santé unique (humaine, animale et environnementale). L’intégration des données « multi-omiques » constitue aujourd’hui un levier essentiel pour accéder à une compréhension globale et systémique des mécanismes biologiques, en particulier dans les interactions complexes hôte–parasite. En combinant différentes couches d’informations moléculaires, cette approche permet de dépasser les analyses unidimensionnelles et de mieux appréhender les dynamiques biologiques sous-jacentes aux processus pathologiques. Néanmoins, cette intégration s’accompagne de défis méthodologiques majeurs, parmi lesquels la gestion et l’harmonisation d’ensembles de données hétérogènes, souvent générés dans des conditions expérimentales variées.
Le candidat (H/F) bénéficiera de l'accès à un restaurant administratif, d'une prise en charge partielle des titres de transport, d'un comité d'entreprise, de la possibilité de télétravail d’une à deux journées pour une partie des activités sous réserve de l’accord du responsable de l’équipe et de formations pour l'adaptation au poste de travail.

Constraints and risks

Déplacement occasionnel en France.
Ne pas être allergique aux piqures d’abeilles.
Travail dans un environnement certifié ISO 9001

Compensation and benefits

Compensation

Entre 2521,95 et 2688,76 euros bruts mensuels selon expérience

Annual leave and RTT

44 jours

Remote Working practice and compensation

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

About the offer

About the CNRS

The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. Its unique position as a multi-specialist allows it to bring together different disciplines to address the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.

CNRS

The research professions