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Portail > Offres > Offre UMR7178-REGSOM-177 - Ingénieur en analyse protéomique (H/F)

Ingénieur en analyse protéomique (H/F)


Date Limite Candidature : mardi 5 mars 2024

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur en analyse protéomique (H/F)
Référence : UMR7178-REGSOM-177
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : mardi 13 février 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 8 mois
Date d'embauche prévue : 18 mars 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2810,67 et 2970,29 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Sciences chimiques et Sciences des matériaux
Emploi type : Ingénieur-e de recherche en analyse chimique

Missions

Développement de méthodes d’analyse protéomique par spectrométrie de masse de type Data Independent Acquisition pour atteindre les meilleures couvertures possibles de protéomes complexes et détecter des protéines présentes à l’état de traces dans des matrices complexes.

Activités

- Mettre en œuvre des analyses protéomiques quantitatives de type label-free (analyse globale) sur des protéomes complexes;
- Réaliser la préparation d’échantillons standards tels que des protéomes de référence, des mélanges de protéomes de référence et/ou avec ajouts de standards protéiques et/ou peptidiques;
- Réaliser des analyses de mélanges peptidiques complexes par nanoLC-MS/MS sur des instruments de type Quadrupole/Orbitrap et Quadrupole/Temps de vol de dernière génération;
- Optimiser les méthodes LC-MSMS pour de très faibles quantités de matériels, allant jusqu’à l’analyse de cellules uniques;
- Réaliser et approfondir le traitement des données MS/MS et des analyses statistiques, en utilisant des outils innovants basés sur des algorithmes d’intelligence artificielle;
- Synthétiser et présenter les résultats des analyses;
- Assurer la traçabilité des analyses dans le cadre de la démarche qualité du LSMBO (environnement ISO9001).

Compétences

Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires :
- Connaissances avancées en chimie bioanalytique, spectrométrie de masse, analyse protéomique. Connaissances en traitement bioinformatique des données MS/MS.

Savoir-faire opérationnels :
- Connaître les différentes stratégies d’analyse protéomique;
- Maîtriser les techniques de chromatographie liquide (chromatographie sur phase inverse) et de spectrométrie de masse en tandem;
- Maîtriser les outils informatiques de traitement des données LC-MS/MS;
- Des connaissances dans des langages de programmation tels que Python et/ou R seraient un réel atout
- Gérer son travail dans un environnement certifié ISO9001 ;
- Communiquer et assurer de bonnes relations avec les interlocuteurs internes et externes ;
- Travailler en équipe et dans un environnement pluridisciplinaire ;
- Avoir une bonne maîtrise de l'anglais écrit et parlé de niveau B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues afin de pouvoir faire des rapports réguliers, participer à la rédaction de publications et présenter ses résultats aux collaborateurs et lors de congrès.

Contexte de travail

L'Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l'Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l'instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 4 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.
Le candidat ou la candidate intègrera l'équipe LSMBO de l'IPHC. Le LSMBO est une équipe spécialisée dans le développement de méthodes d'analyses de biomolécules par spectrométrie de masse et des stratégies bio informatiques associées.
Le LSMBO est une équipe du Département des Sciences Analytiques de l’IPHC (UMR7178, CNRS/Université de Strasbourg), et regroupe une vingtaine de personnels permanents (chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs et techniciens), une quinzaine de personnels non-permanents (doctorants, chercheurs, ingénieurs d’études) et des étudiants stagiaires, enseignants-chercheurs, ingénieurs et techniciens), une quinzaine de personnels non-permanents (doctorants, chercheurs, ingénieurs d’études) et des étudiants stagiaires.

Le candidat ou la candidate interagira au quotidien avec l'ensemble du personnel du LSMBO incluant ingénieurs en spectrométrie de masse, informaticiens et bioinformaticiens, Il/Elle interagira également avec des collaborateurs externes du laboratoire.

Contraintes et risques

-Travail dans un environnement certifié ISO 9001