Missions

Dans le cadre du projet européeen EIC Pathfinder DREAM (https://dream-eic.eu/), l'agent (H/F) sera en charge du développement des systèmes microfluidiques utilisés au laboratoire pour imager des cellules d'algue chlamydomonas par microscopie time lapse. L'équipe étant très inter-disciplinaire, l'agent (H/F) aura la possibilité d'étoffer progressivement ses responsabiltés et son expertise vers les techniques biologiques utilisées au laboratoire et l'analyse d'image par apprentissage profond (suivi automatisée de la division cellulaire). Le projet, qui se déroulera en collaboration avec une équipe de l'IPGG à Paris, a pour objectif de réaliser un système expérimental complet permettant l'images de cellules individuelles sur des échelles multi-générationnelles dans des conditions d'illumination contrôlées.

Activités

- Microfluidique : développement de moules par lithographie SU8 à plusieurs couches. L'équipe possède une micro-salle blanche pour réaliser tous les échantillons au laboratoire
- Impression 3D (extrusion et SLA) pour réaliser la connectique et les supports d'échantillon
- Instrumentation : mise au point de systèmes de controle de température et de flux (hardware et software).
- Utilisation des microscopes automatisés du laboratoire et intégration des hardwares sur micromanager

Compétences

- Connaissances pratiques approndies en microfabrication (SU8) et PDMS
- Connaissances en programmation (Python ou Matlab ou Arduino IDE) pour le pilotage d'instruments
- Connaissance en conception de circuits électroniques simples
- Conception et intégration de pièce mécaniques et optiques
- Capacité à communiquer et travailler en équipe dans un environnement interdisciplinaire

Contexte de travail

La laboratoire Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie (GMGM), situé au coeur de l'Université de Strasbourg (campus esplanade), est composé de 6 équipes qui s'intéressent à différentes problématiques autour de la microbiologie et la génétique moléculaire. L'équipe appelée "biologie quantitative de la croissance cellulaire" , s'est récemment installée dans le laboratoire et compte actuellement 6 membres, dont 3 permanents. L'équipe est composée de physiciens et de biologistes à part égale.
L'agent (H/F) recrutée aura accès à un service de restauration collective, une prise en charge partielle des transports en commun, et au CAES. Il n'existe pas d'astreinte spécifique.

Contraintes et risques

Plusieurs déplacements à Paris à prévoir