Missions

Les microARN sont de courts brins d'ARN endogènes qui ajustent finement l'expression génique par la régulation post-transcriptionnelle. Libérés de manière stable dans les fluides biologique, ils sont considérés comme des biomarqueurs prometteurs pour les biopsies liquides dans un large éventail d'applications cliniques. Cependant, des défis analytiques restent à relever, notamment la sensibilité, la spécificité, le multiplexage et la quantification.

Notre équipe est à la recherche d’un.e postdoctorant.e motivé.e pour travailler au développement de technologies de détection de microARN. Le poste, financé par une bourse européenne ERC Starting Grant, est ouvert dans le laboratoire Gulliver (ESPCI Paris, Université PSL, au cœur de Paris). Le projet a pour but de combiner des concepts de programmation moléculaire, des techniques microfluidiques et de séquençage ADN pour créer la prochaine génération de tests de détection de microARN.
Information projet : https://blog.espci.fr/guillaumegines/erc-mop-mip/

Publications d’intérêt: https://blog.espci.fr/guillaumegines/publications/

Activités

Le/la candidat.e retenu.e se concentrera sur une méthodologie originale permettant la détection digitale et multiplexée des microARN. La méthodologie à mettre en place implique la fonctionnalisation de microparticules avec des brins d'ADN, la microfluidique en gouttes et le séquençage ADN de nouvelle génération. Le/la candidat.e s'appuiera sur l'expertise solide du laboratoire dans la conception et l'assemblage de programmes moléculaires à base d'oligonucléotides d'ADN et d'enzymes, et capables de traitement de l'information. Les activités de recherche impliquent :

- Revue de la littérature et compilation de données
- Conception, exécution et analyse d'expériences de biologie moléculaire pour valider les méthodes développées
- Séquençage ADN et analyse des runs
- Présentation des résultats de la recherche lors de conférences scientifiques et publication d'articles de recherche dans des revues à comité de lecture
- Collaboration avec d'autres chercheurs du laboratoire et participation à des réunions et discussions en laboratoire
- Communication scientifique (rédaction de publications scientifiques, participation à des conférences)

Compétences

Le/la candidat.e devra posséder un doctorat en biochimie, biologie moléculaire ou dans un domaine connexe. De plus, il est attendu qu’il/elle ait une solide formation en techniques standards de biologie moléculaire, telles que les tests enzymatiques, l'amplification d'ADN, l'extraction d'ARN, la microscopie, et d'autres méthodes pertinentes. Une expérience antérieure en séquençage de nouvelle génération, y compris la préparation de bibliothèques et l'analyse de données, est également requise.

Le candidat retenu devrait être capable d'évoluer dans un environnement hautement interdisciplinaire, avoir un esprit d'indépendance et bien travailler en équipe. Bien que l'expérience antérieure dans le domaine des microfluidiques en gouttelettes ne soit pas requise, elle sera considérée comme un atout. De plus, la maîtrise de langages de programmation tels que Python, Matlab ou Mathematica sera prise en compte.

Contexte de travail

Information projet : https://blog.espci.fr/guillaumegines/erc-mop-mip/
Publications d'intérêt: https://blog.espci.fr/guillaumegines/publications/
Information laboratoire Gulliver: https://www.gulliver.espci.fr/?-home-