Missions

L’Ingénieur.e travaillera sur des invertébrés marins, en particulier les ascidies. L’objectif du projet est de mettre en place des tests d’innocuité sur des larves d’ascidie par imagerie à haut débit entièrement automatisée sur un microscope à épifluorescence

Activités

• Cultures larvaires d’ascidies des espèces Phallusia mammillata et Ascidiella aspersa en plaques 96 puits
• Imagerie 3D et fluorescence multi-canaux de larves d’ascidies.
• Programmation de solutions software pour la prise d’images automatisée (avec l’aide de la plateforme d’imagerie microscopique (PIM) de l’IMEV.
• Quantifications morphométrique des phénotypes larvaires par analyse à haut contenu avec le logiciel protégé Toxicosis et en python.
• Mise en place du plan de gestion des données sur les images de larves d’ascidies.

Compétences

Maîtrise des bases théoriques et pratiques des cultures larvaires d’organismes marins,
• Bonne connaissance des méthodes d’imagerie de microscopie et du langage python.
• Capacité à être autonome dans l’interprétation et la présentation des résultats, notamment lors de réunions d’équipe,
• Compétence dans le développement et l’utilisation d’outils et de méthodes expérimentales de manière fiable et reproductible,
• Capacité à travailler de manière autonome dans un environnement interdisciplinaire et international,
• Esprit d’équipe, capacité d’adaptation et volonté d’interagir scientifiquement au sein d’un groupe de recherche dynamique,
• Sens de l’observation et attention portée aux animaux et embryons,
• Respect des règles et procédures en vigueur au laboratoire et à l’animalerie de recherche,
• Maîtrise de l’anglais scientifique, à l’oral comme à l’écrit (anglais courant).

Contexte de travail

Le poste est basé sur le campus de l’IMEV dont les tutelles sont Sorbonne Université et le CNRS, un environnement particulièrement riche pour la recherche en biologie, situé à proximité de plusieurs laboratoires de l’Université Côte d’Azur (UCA) tels que l’Institut de Biologie de Valrose, l’IRCAN, la Faculté de Médecine (campus Pasteur à Nice), ainsi que du technopôle Sophia-Antipolis. L’IMEV emploie environ 220 personnes et dispose d’équipements scientifiques de pointe, répartis sur plusieurs plateformes technologiques (biologie moléculaire, imagerie, spectrométrie de masse) ainsi qu’un service d’aquariologie et de moyens à la mer (navires, dispositifs de plongée). Le laboratoire est également doté d’installations de culture d’invertébrés marins permettant de boucler les cycles de vie et de réaliser toutes les étapes de la génétique moléculaire sur plusieurs espèces modèles.
L’Ingénieur.e développera son projet au sein de l’équipe « Ascidian BioCell » du Laboratoire de Biologie du Développement (https://lbdv.imev-mer.fr/ ), unité mixte Sorbonne Université / CNRS, située à Villefranche-sur-Mer. Ce projet est la réalisation du WP7 du projet européen EUREMAP (https://euremap.eu/ ) en collaboration avec les chimistes de la plateforme BIO2MAR de l’observatoire oceanologique de Banyuls (https://www.obs-banyuls.fr/index.php/fr/rechercher/plateformes/bio2mar.html ) et le service d’aquariologie, plateforme technologique labellisée Sorbonne Université -EMBRC-FR au sein de l'Institut de la Mer.

Contraintes et risques

L’Ingénieur.e travaillera, selon un agenda prédéfini, principalement au sein de l’équipe mentionnée ci-dessus. Il/Elle suivra les horaires convenus dans le cadre du contrat (temps plein), en respectant les créneaux réguliers d’ouverture des structures concernées. L’Ingénieur.e sera soumis aux risques inhérents au travail de laboratoire en biologie ainsi qu’au travail en animalerie aquatique de recherche (bruit, humidité ambiante).