Missions

Dans le cadre du projet SIQUOMOR (ANR), il est proposé de développer un biocapteur pour la quantification en mer de cellules des espèces des dinoflagellés du genus Ostreopsis. Dans le biocapteur, les cellules d'Ostreopsis seront identifiées moléculairement à l'aide de sondes ADN spécifiques. L'ingénieur/e sera responsable de l'identification des séquences spécifiques aux différentes espèces d'Ostreopsis (Ostreopsis ovata et Ostreopsis siamensis) à utiliser dans le prototype.

Activités

Dans le cadre du projet, l’ingénieur/e serait responsable de générer les donnes transcriptomiques pour Ostreopsis siamensis a partir des cultures monoclonales disponible dans le laboratoire, d’analyser ces donnes et les comparer avec les donnes transcriptomiques de Ostreopsis ovata déjà disponible dans l’équipe, pour identifier séquences et gènes spécifiques pour les deux espèces et leur profile d’expression pendant la prolifération cellulaire.

Compétences

Expérience en analyse transcriptomique et en analyse d'expression génique différentielle est essentielle. Le candidat doit être familier avec l'utilisation de DESeq2, ou LIMMA R ou programmes équivalents.
Expérience en culture cellulaire, extraction d'ARN et biologie moléculaire est souhaitée, mais pas obligatoire.

Contexte de travail

Le poste est rattaché à l’équipe ‘Mitosis and Spindle checkpoint’, au Laboratoire de Biologie du développement de Villefranche sur mer (CNRS-Sorbonne Universités). L’équipe a expérience en biologie cellulaire et en particulaire dans la biologie cellulaire des dinoflagellés.