Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur en Bioinformatique (H/F)
Référence : UMR6293-HEISER-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : CLERMONT FERRAND
Date de publication : vendredi 4 octobre 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 13 mois
Date d'embauche prévue : 18 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2847 € brut mensuel selon experience
Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Missions
Nous recherchons un bioinformaticien très motivé pour travailler sur le projet ERC MeioPoly, qui vise à élucider les mécanismes de l'adaptation méiotique à l'allopolyploïdie. L'hybridation entre espèces apparentées conduit à la formation d'organismes allopolyploïdes confrontés à des changements génomiques, épigénomiques et transcriptomiques qui doivent être surmontés pour que cette nouvelle espèce survive. La recombinaison méiotique entre les sous-génomes (hérités des progéniteurs) peut conduire à des réarrangements génomiques hautement délétères et doit être évitée. En utilisant l'allotétraploïde Arabidopsis suecica comme modèle, le projet MeioPoly a pour objectif de décrypter les processus évolutifs permettant la stabilisation méiotique des jeunes allopolyploïdes.
Le candidat retenu développera des outils informatiques pour caractériser les variations génétiques, les réarrangements chromosomiques, ainsi que les changements épigénomiques et transcriptomiques pour élucider les bases de la stabilité méiotique et de la fertilité des allopolyploïdes naissants.
Activités
- Développement de pipelines pour répondre aux questions biologiques posées
- Analyse de données NGS (RNA-seq, ChIP-seq...)
- Mise en forme des données en vue de l'écriture de publications
Compétences
Les candidats doivent être titulaires d'un Master II ou d'un doctorat en bioinformatique.
- Capacité à développer des méthodes et des pipelines pour analyser, gérer et interpréter des jeux de données biologiques
- Excellentes compétences en programmation et solides capacités d'analyse et de résolution de problèmes
- Expertise en séquençage long reads (ONT), ChIP-seq et RNA-seq
- Capacité à travailler de manière autonome et en coopération avec les autres membres de l'équipe
- Maîtrise de l'anglais scientifique
Contexte de travail
La personne recrutée rejoindra l’équipe « Recombinaison et maintenance de l’intégrité du génome » de l’iGReD (Institut de Génétique, Reproduction et Développement) à Clermont-Ferrand en France. Les 15 équipes de recherche de l’iGReD ont pour objectif de comprendre les programmes génétiques et épigénétiques associés à la reproduction et au développement normal et pathologique, et fournissent un environnement scientifique dynamique et coopératif.
Contraintes et risques
n.a.
Informations complémentaires
La date d'embauche est flexible (mi-novembre 2024 à février 2025).
La durée du contrat est de 13 mois, renouvelable deux fois.