Missions

Au sein de l'équipe MCB dirigée par Marc Tramier, l'IR travaillera pour le projet i-Demo Roboscope. Il/elle mettra en œuvre des applications en biologie cellulaire de microscopie intelligente automatisée sur le prototype Roboscope.

Activités

- culture cellulaire et expression de protéines recombinantes
- biologie moléculaire pour la préparation de plasmides
- préparation des échantillons pour les expériences de microscopie
- finalisation du prototype de microscope intelligent automatisé en faisant intervenir les différents partenaires compétents
- mise en place des expériences de preuves de concept sur le prototype de microscope intelligent automatisé
- exploiter et présenter les résultats de ces acquisitions, en garantir le suivi et la qualité
- création de bibliothèques d'images annotées pour l'apprentissage d'algorithmes d'intelligence artificielle
- définir un cahier des charges détaillées pour le développement d'une interface utilisateur du prototype
- rédiger des rapports d'expériences et des publications
- assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité

Compétences

- connaissances et expérience en microscopie de fluorescence appliqué à la biologie
- connaissances en biologie cellulaire, biologie moléculaire et expérience en préparation d'échantillons cellulaires
- gestion autonome de projet, interaction avec une équipe pluridisciplinaire

Contexte de travail

L'Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR) est une unité mixte de recherche (UMR) du CNRS associée à l'université de Rennes. L'IGDR compte environ 200 personnes et accueille 16 équipes de recherche et œuvre à l'intersection de la recherche, de l'éducation et de la santé. En Bretagne, l'IGDR est actuellement le principal institut de recherche dédié à la recherche fondamentale en biologie.
L'équipe “Microscopy for Cell Biosensing”, dirigée par Marc Tramier, conçoit des techniques et méthodes de visualisation sur échantillons vivants des interactions entre protéines et des activités biochimiques. Elle développe des outils originaux en microscopie et les utilise pour répondre à des questions biologiques pertinentes.
Le projet Roboscope vise à développer un microscope intelligent automatisé. Le consortium de travail est constitué de deux équipes de l'IGDR (M Tramier et J Pécréaux) et des sociétés Inscoper (coordinateur) et First Light Imaging. Le projet reçoit actuellement un financement i-Demo (BPI et région) pour la période 2025-2028.