CDD chercheur H/F Interactions microalgues-bactéries, expérimentation biologique et bioinformatique

Description du Poste

Les Missions

Missions :
Concevoir et mettre en œuvre des expérimentations visant à caractériser les interactions entre micro-algues et bactéries, en cultures individuelles et en co-cultures.
Mettre en place et suivre des expérimentations de physiologie microbienne et algale dans des conditions contrôlées.
Produire et analyser des données moléculaires, biochimiques et physiologiques permettant de caractériser les réponses des microorganismes aux différentes conditions expérimentales.
Contribuer à la caractérisation des mécanismes moléculaires et métaboliques impliqués dans les interactions micro-algues bactéries.
Générer, traiter et intégrer des données multi-omiques afin d'identifier les mécanismes biologiques et les réponses fonctionnelles des microorganismes étudiés.
Participer à l'interprétation intégrée des résultats, à la valorisation scientifique des travaux et à la rédaction de publications et communications scientifiques.
Assurer la traçabilité, l'organisation et la documentation des données et protocoles expérimentaux.

L'Activité

Réalisation, en conditions stériles, des cultures de bactéries et de micro-algues séparément et en co-culture.
Extraction d'ADN, ARN, protéines et métabolites
Réalisation de PCR, QPCR, WB, microscopie,
Expérience de Physiologie
Clonage, mutagénèse et transformation
Analyse bioifnormatique à haut débit (RNA seq, assemblage, meta données, métabolomique et intégration de données omiques)

Votre Profil

Compétences

Compétences expérimentales:
Maîtrise des techniques de culture de bactéries et de micro-algues en conditions stériles et contrôlées.
Maîtrise des techniques de biologie moléculaire : extraction d'ADN et d'ARN, PCR/qPCR, clonage, mutagénèse et transformation.
Expérience en extraction et analyse de protéines et de métabolites.
Bonne expérience des techniques de microscopie.
Expérience en expérimentation physiologique et en suivi de paramètres de croissance et de réponses cellulaires.
Compétences en bioinformatique:
Maîtrise de l'analyse de données de séquençage haut débit, notamment RNA-seq.
Expérience en assemblage et analyse de données génomiques et/ou métagénomiques.
Expérience dans l'analyse et l'intégration de données multi-omiques, notamment transcriptomiques et métabolomiques.
Capacité à traiter, analyser et interpréter des jeux de données biologiques à haut débit.
Maîtrise d'un ou plusieurs environnements/outils de programmation et d'analyse de données (R, Python, environnement Linux, etc.).
Capacité à intégrer des données expérimentales de nature différente et à établir des liens entre données moléculaires, physiologiques et métaboliques.
Compétences transversales:
Capacité à planifier des expérimentations de manière autonome.
Rigueur dans la réalisation, la documentation et l'analyse des expériences.
Capacité à interpréter des résultats complexes et à formuler des hypothèses scientifiques.
Aptitude au travail en équipe et à l'interaction avec des chercheurs de différentes disciplines.
Bonnes capacités de communication scientifique en anglais, à l'écrit comme à l'oral.
Capacité à valoriser les résultats sous forme de rapports, présentations et publications scientifiques.

Votre Environnement de Travail

Le contrat pourra être éventuellement renouvelé dans la limite du financement jusqu'à 36 mois .Le poste est à pourvoir au sein de l'équipe « Epigénomique des microalgues et interactions avec l'environnement », au sein du laboratoire US2B (UMR 6286). L'équipe s'intéresse à la réponse moléculaire, et en particulier épigénétique, des microalgues à leur environnement, qu'il soit biotique (bactéries) ou abiotique (sel, température, carence en nutriments, stress photo-oxydatif). La personne recrutée travaillera principalement avec Leïla Tirichine

Contraintes et risques

Aucun

Rémunération et avantages

Rémunération

3070 et 4260 euros brut mensuel selon expérience

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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